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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004317`

染色体: Chr08 坐标: 52880955-52882618 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004317`
名称	SmilChr08G004317
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52880955 - 52882618 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999035`
GeneID	`130999035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999035`
原始查询	`LOC130999035`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
产物	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
Arabidopsis	`AT5G49690` (AT5G49690) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835032] identity=39; qcov=0.967; evalue=9.72e-110; confidence=medium
Rice	`Os01g0865400` - identity=40.7; qcov=0.994; evalue=7.79e-101; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00201 (UDPGT); PF26168 (Glyco_transf_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999035

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780487.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780487.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780487.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780487.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52881082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C53
`Chr8:52881424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B134,C1,C42,C60
`Chr8:52881644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:52881809`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B41,B61,C54
`Chr8:52882055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:52882059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B21
`Chr8:52882112`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780487.1

485 aa

242

485

Glyco_transf_N

UDPGT

PF26168 Glyco_transf_N 13-192 aa PF00201 UDPGT 291-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780487.1`	Pfam	`PF26168`	Glyco_transf_N	Domain	13	192	2e-10	41.7	Glycosyltransferase, N-terminal domain
`XP_057780487.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	291	439	2.6e-14	53.6	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924504.1
ATGTCACTCTCCCACCAATATTACACAATCTGACAACACACACACCAATAATACACAATCTGACAACACACACAGAGTGATCAAAAGTGTTGAAATTAAAGAGTTGATATGAATAAGGATGGAAGAAGAATGAGTGAAGAAAATGAGGTTCATGTTGTGATGCTGCCATGGCTGGCATTTGGTCACATGATCCCATTCTTGGATCTCTCTATTGCCTTAGCCAAATTTGGCATTCATGTCTCCTACATCTCTACTCCCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999035
ATGAATAAGGATGGAAGAAGAATGAGTGAAGAAAATGAGGTTCATGTTGTGATGCTGCCATGGCTGGCATTTGGTCACATGATCCCATTCTTGGATCTCTCTATTGCCTTAGCCAAATTTGGCATTCATGTCTCCTACATCTCTACTCCCCAAAACATTCCAAGACTCCCCCAAATCCCACCAAATCTCTCACAGTTCATCGAATTCGTGCCCCTTCCTCTCCCCAGCCTCGACTCCGATCCCCTACCGGAGAACGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780487.1
MNKDGRRMSEENEVHVVMLPWLAFGHMIPFLDLSIALAKFGIHVSYISTPQNIPRLPQIPPNLSQFIEFVPLPLPSLDSDPLPENAEATTDIPAERMDDLKIACDLLQEPIKNVIAEKSPSWIMVDFFHHWAVDIAQELDIPLIFFSISTASTLVFFWSPEFLAGEGRRQARPSPANMMAPPDWVDFPSQVACRNDHEAVVMHNQLYRTGASGIEDAARLAKLIQGSHALALRSCVELEGDYLKVYSNITGKPVFPVGCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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