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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004303`

染色体: Chr08 坐标: 52711480-52713215 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004303`
名称	SmilChr08G004303
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	52711480 - 52713215 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999039`
GeneID	`130999039`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999039`
原始查询	`LOC130999039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
产物	putative UDP-rhamnose:rhamnosyltransferase 1
Arabidopsis	`AT2G22590` (AT2G22590) UDP-Glycosyltransferase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816790] identity=38.9; qcov=1.05; evalue=2.53e-100; confidence=medium
Rice	`Os03g0804900` - identity=37.2; qcov=1.06; evalue=3.38e-97; confidence=medium
GO	GO:0008194 (UDP-glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00201 (UDPGT); PF26168 (Glyco_transf_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999039

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780491.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780491.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780491.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780491.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780491.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:52711724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr8:52711742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:52711853`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A21,B126,C19,C47
`Chr8:52711853`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A21,B126,C19,C47
`Chr8:52712005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C58,D11
`Chr8:52712023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:52712041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C12,C13
`Chr8:52712221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C81
`Chr8:52712330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:52712411`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A9
`Chr8:52712411`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A9
`Chr8:52712709`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780491.1

450 aa

225

450

Glyco_transf_N

UDPGT

PF26168 Glyco_transf_N 10-216 aa PF00201 UDPGT 259-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780491.1`	Pfam	`PF26168`	Glyco_transf_N	Domain	10	216	4.7e-09	37.2	Glycosyltransferase, N-terminal domain
`XP_057780491.1`	Pfam	`PF00201`	UDPGT	Family	259	405	7.7e-11	42.2	UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924508.1
ATAAGTGATTGTAACTAAATTGAGTGTCTGAGACATGTTAAAAAGAAAAAAGTGAAATTATGTCCAAAAAATAAAACGTGGTCCAAAATTCACGTTTGATATCTGGTAGGCCAAGGATAATAAACATGGAGATTTTTTTTGTTTCTTTATAAACATTGGTTCACAACCTCAAACCAATATACAGACACCCACAGTGATCACAAGAGTTAGTCAACATGAAAAAGGGTGGGAGTGAAGAAAATGAGGTTCATGTTGTGATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999039
ATGAAAAAGGGTGGGAGTGAAGAAAATGAGGTTCATGTTGTGATGCTGCCATGGCTGGCATTTGGTCACATGATCCCATACTTGGATCTCTCTATTGCCTTAGCCAAATTCGGCATTCATGTCTCCTTCATCTCTACTCCCCGAAACATTTCAAGACTCCCCAAAATCCCACCAAATCTGTCACAGTTCATCGAATTTGTGGCCCTTCCTCTCCCCAAGCTCGAGTCGGATCCCCTGCCGGAGAATGCTGAAGCCACGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780491.1
MKKGGSEENEVHVVMLPWLAFGHMIPYLDLSIALAKFGIHVSFISTPRNISRLPKIPPNLSQFIEFVALPLPKLESDPLPENAEATTDIPLERMDDLMIACDLLREPVKKVIAEKSPNWILVDFFYHWAADIALELDVPLILYIVVSAASAVFFEGQRQASTSPQDMTVPPDHETEASTPGMEAAARVIRITQGCKAIVVRTCPELEADYLKSFSKMTGRPVIPMGCLPPETVEEASVNGEEPWSGVFGWLDKQKPKSVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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