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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004338`

染色体: Chr08 坐标: 53038424-53041749 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004338`
名称	SmilChr08G004338
描述	beta-amylase 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53038424 - 53041749 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999065`
GeneID	`130999065`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999065`
原始查询	`LOC130999065`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-amylase 2, chloroplastic
产物	beta-amylase 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G00490` (BAM2) beta-amylase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827959] identity=77.1; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0569200` - identity=77.7; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000272 (polysaccharide catabolic process); GO:0016161 (beta-amylase activity)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01373 (Glyco_hydro_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999065

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780519.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780520.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057780519.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780520.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53038807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B129,B14,D3
`Chr8:53038849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B34
`Chr8:53038896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:53039545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:53039546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B83,C46,C86
`Chr8:53039566`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B53,C8
`Chr8:53039566`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B53,C8
`Chr8:53039781`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C85
`Chr8:53040248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B107,B123,B129,B14
`Chr8:53040273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B133,B52,C37
`Chr8:53040480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B133,C37
`Chr8:53040481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B133,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780519.1

552 aa

276

552

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 101-525 aa

XP_057780520.1

442 aa

221

442

Glyco_hydro_14

PF01373 Glyco_hydro_14 12-415 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780519.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	101	525	3.5e-129	432.3	Glycosyl hydrolase family 14
`XP_057780520.1`	Pfam	`PF01373`	Glyco_hydro_14	Domain	12	415	8.5e-126	421.1	Glycosyl hydrolase family 14

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924536.1
CGCAACCCTGCCTCCAGTTTCACGGATTCCGTTACTTACCCGGGCCCGCCATCTATCTCTCACTATATATCACTCTCTCACACAAACTGCGTGTGTGTCTGTGTACACGAGAACTAAGCTGCAGAGAGAGACATAGAACTAATTGAGAATGGCGGTTAATCTTTCACGCAGCTCCACGCTGCTCCGCACAATGAATTCTGCTCCGTCGGTGGCGGTTCCGCGTCTTTCTCCGATTGTAATTCGCGGTGGTCGGAAAGCAG...

XM_057924537.1
TCAGGAGCGAGACTATACTGGCACGCCTTACGTTCCAGTCTTCGTGATGCTACCTGTGAGTTGCAAATCATCTGTGACATGTTACACCACTTCCATTAACTAACTTTTGCTTGAATTTGGGACTCATCAATATGGATTGTGAGTTGGTTGATGCTGATGACTTGATAAACCAACTGAGAATCCTTAAATCGATTAATGTTGATGGTGTTATGGTTGATTGCTGGTGGGGCATAGTTGAAGCACATACCCCTCAGCAATAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999065
ATGGCGGTTAATCTTTCACGCAGCTCCACGCTGCTCCGCACAATGAATTCTGCTCCGTCGGTGGCGGTTCCGCGTCTTTCTCCGATTGTAATTCGCGGTGGTCGGAAAGCAGTTCAGCTCTGTTCCGGCAAATTGAGCGGTTCACTGAAATCTGGCCTTCGCTGTCGCGCAATGGTCGGAGAAGCTGCGGAGGAAATCAAGGAAGATGATAGCGTTTCGCTTGATGATTCCGCGGCTGCTTCTTCGAAGAACCAGCAGGT...

LOC130999065
ATGGATTGTGAGTTGGTTGATGCTGATGACTTGATAAACCAACTGAGAATCCTTAAATCGATTAATGTTGATGGTGTTATGGTTGATTGCTGGTGGGGCATAGTTGAAGCACATACCCCTCAGCAATATAACTGGTCCGGCTATAGGAAGCTGTTTCAGATTGTACGAGATCTTGATCTCAAGCTGCAAGTGGTTATGTCTTTTCATGAATGTGGAGGCAACGTTGGTGATGATGTGCATATTCCGCTTCCACAATGGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780519.1
MAVNLSRSSTLLRTMNSAPSVAVPRLSPIVIRGGRKAVQLCSGKLSGSLKSGLRCRAMVGEAAEEIKEDDSVSLDDSAAASSKNQQVQERDYTGTPYVPVFVMLPLGLINMDCELVDADDLINQLRILKSINVDGVMVDCWWGIVEAHTPQQYNWSGYRKLFQIVRDLDLKLQVVMSFHECGGNVGDDVHIPLPQWVMEIGSSNPDIFFTDKEGRRNHECLTWGIDKQRVLKGRNALEVYFDYMRSFRVEFNEFFEDGFI...

XP_057780520.1
MDCELVDADDLINQLRILKSINVDGVMVDCWWGIVEAHTPQQYNWSGYRKLFQIVRDLDLKLQVVMSFHECGGNVGDDVHIPLPQWVMEIGSSNPDIFFTDKEGRRNHECLTWGIDKQRVLKGRNALEVYFDYMRSFRVEFNEFFEDGFISEIEIGLGACGELRYPSYPANHGWEYPGIGEFQCYDKYLIESLEKAAEARGHSIWGRAPDSAGSYNSKPQDTRFFCDGGDYDGHYGRFFLKWYSGILVDHADRVLAMANI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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