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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004347`

染色体: Chr08 坐标: 53128309-53131290 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004347`
名称	SmilChr08G004347
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 12-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53128309 - 53131290 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999073`
GeneID	`130999073`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999073`
原始查询	`LOC130999073`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 12-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 12-like
Arabidopsis	`AT1G32360` (AT1G32360) Zinc finger (CCCH-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840128] identity=55.8; qcov=1.13; evalue=1.76e-123; confidence=high
Rice	`Os08g0159800` (OsC3H56) - identity=57.6; qcov=0.989; evalue=2.92e-124; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00642 (zf-CCCH); PF18044 (zf-CCCH_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999073

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780530.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780530.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780530.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780530.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53129271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:53129296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B110,C82,D4
`Chr8:53129556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:53129775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B99,C81,C87
`Chr8:53129856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:53130834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,C41,C50,C53
`Chr8:53130869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:53130923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:53131001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780530.1

351 aa

176

351

zf-CCCH

zf-CCCH_4

zf-CCCH

PF00642 zf-CCCH 99-123 aa PF18044 zf-CCCH_4 173-195 aa PF00642 zf-CCCH 240-265 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780530.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	99	123	4.1e-20	71.9	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
`XP_057780530.1`	Pfam	`PF18044`	zf-CCCH_4	Domain	173	195	5.4e-12	45.9	CCCH-type zinc finger
`XP_057780530.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	240	265	4.1e-20	71.9	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924547.1
GGGGAAGAAGAAGAAAATAGAAAAGGAGATGAGGGAAAAGAAAACACAGAAAATGTAGGCGTGTTTGGTTGCAAGAATATAAATCGCGTGAATTTAGATGGATTGTCGCACTACACTTGCAACCAAACGAGTCCACACAAATCCTTTCCTATGTGTTTTCGGCACACACATTCAATGAGAGTTGAGTGCAGTTTCATCAATTTTGTCTGATTACTTACCCAGTTACTTCTTCCAACTGTCTGATTAATAAAAATCAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999073
ATGGATTATCGTCGTGAGAATCGATTATCTAGTGGCGATGTGGTTCATGTTCTATCCGGGAGCTCCCGGAATCCTGTCAACGAGAGTTGGGAACCCGGGTTCGTTGATCAAGCAGTTTGGGCCACAGAGGATGACTATGGGATGTGGAATGGAGAAGGCTCTTTCGACACCAATTCAAACTCGAGCTATGATGGGGCTCGTTCAGGAAGTGAACCACCGAATAAGAGATCAAGGGGTTCCAATTCAGGAGACGGGGCAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780530.1
MDYRRENRLSSGDVVHVLSGSSRNPVNESWEPGFVDQAVWATEDDYGMWNGEGSFDTNSNSSYDGARSGSEPPNKRSRGSNSGDGAASNRSKAIGKMFYKTKLCCKFRAGTCPYITNCNFAHSVEELRKPPDNWQEIVAAHEEERASSSEPREEFQIPIVGVSDETQRSYKGRHCKKFYTEEGCPYGENCTFLHDEQSKARESVAISLGPGSGNGNGNGNGGGSGYGASASGPTLKPSNWKTRICNKWELTGYCPFGSKC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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