当前解析结果
SmilChr08G004364| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004364 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004364 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G004364 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 53368899 - 53370893 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999092 |
|---|---|
| GeneID | 130999092 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999092 |
| 原始查询 | LOC130999092 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | LDL receptor wingless signaling/trafficking chaperone [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819208]; symbol=AT2G46000; hit=AT2G46000; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | LDL receptor wingless signaling/trafficking chaperone [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819208]; symbol=AT2G46000; hit=AT2G46000; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G46000 (AT2G46000)LDL receptor wingless signaling/trafficking chaperone [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819208] identity=53.7; qcov=0.926; evalue=1.32e-48; confidence=medium |
| Rice | Os03g0148300- identity=53.6; qcov=0.882; evalue=1.79e-45; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999092 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.60000 | XP_057780559.1 |
| 2 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.20000 | XP_057780559.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum lumen | 内质网腔 | 0.20000 | XP_057780559.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057780559.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057780559.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:53369201 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr8:53370671 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B6 |
Chr8:53370711 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B130,B6 |
Chr8:53370742 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B36 |
Chr8:53370800 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B33,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。