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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004369`

染色体: Chr08 坐标: 53435298-53438088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004369`
名称	SmilChr08G004369
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53435298 - 53438088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999097`
GeneID	`130999097`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999097`
原始查询	`LOC130999097`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa
产物	ubiquitin-conjugating enzyme E2-23 kDa
Arabidopsis	`AT1G63800` (UBC5) ubiquitin-conjugating enzyme 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842683] identity=80.8; qcov=1.03; evalue=4.13e-107; confidence=high
Rice	`Os10g0447100` (OsUBC10) - identity=92.1; qcov=0.765; evalue=6.82e-96; confidence=high
GO	GO:0000209 (protein polyubiquitination); GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0061631 (ubiquitin conjugating enzyme activity)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999097

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780566.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780566.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780566.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780566.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780566.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53435552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B126,B77,C19,C47
`Chr8:53436498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr8:53436869`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780566.1

183 aa

183

UQ_con

PF00179 UQ_con 9-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780566.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	9	142	5.9e-41	140.1	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924583.1
GTTATATATATATTGAGAGAGAGAAGTTTGGTGAGGAATGTTGGTAATGGAAGCCACAGTAAACTAAAAATAGTAGTGATGGATAATCAGATATGGTGTGCGAAATAGGAGCCGTAATCATCATAAAGGTTAACTTCACCACACACACTGGTTTATCTTCATTCTCTGCTTTCCATAGTTGAAAAAGCAGCTCCTATTCTTGCTTTTCTTTCTCCTTCACCCCCTCCTTCCTTTCCTCTCTCAAAAATCAAGCCCAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999097
ATGTCTTCACCAAGCAAGAGGCGAGAGATGGACTTAATGAAACTGATGATGAGTGATTACAAGGTGGAGATGATGAATGATGGAATGCAGGAGTTCTATGTGCATTTCCATGGACCCACTGACAGTCCATATCACGGTGGGGTATGGAAGATAAGAGTCGAGCTTCCCGATGCATATCCCTACAAGTCTCCTTCCATAGGATTTATTAACAAGATATATCACCCCAATGTGGATGAAATGTCAGGTTCAGTTTGTCTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780566.1
MSSPSKRREMDLMKLMMSDYKVEMMNDGMQEFYVHFHGPTDSPYHGGVWKIRVELPDAYPYKSPSIGFINKIYHPNVDEMSGSVCLDVINQTWSPMFDLVNVFEVFLPQLLLYPNPSDPLNGEAAALMMRDRTAYEQRVKEYCLKYAKAEDAGAVPEEKSSDEELTEDEYESSDEAVLGPVDP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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