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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004405`

染色体: Chr08 坐标: 53722874-53726600 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004405`
名称	SmilChr08G004405
描述	tRNA-specific adenosine deaminase TAD1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53722874 - 53726600 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999128`
GeneID	`130999128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999128`
原始查询	`LOC130999128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA-specific adenosine deaminase TAD1-like
产物	tRNA-specific adenosine deaminase TAD1-like
Arabidopsis	`AT1G01760` (AT1G01760) denosine deaminases acting on tRNA [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839252] identity=52.3; qcov=1.05; evalue=9.72e-117; confidence=high
Rice	`Os04g0683500` (OSJNBa0032F06.25) - identity=51.6; qcov=0.693; evalue=6.18e-77; confidence=high
GO	GO:0003725 (double-stranded RNA binding); GO:0003726 (double-stranded RNA adenosine deaminase activity); GO:0005730 (nucleolus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006382 (adenosine to inosine editing); GO:0006396 (RNA processing); GO:0008251 (tRNA-specific adenosine deaminase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02137 (A_deamin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780609.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057780609.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057780609.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780610.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780610.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53723112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B79
`Chr8:53725422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B79
`Chr8:53725441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C84
`Chr8:53725719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C63,C67,C84
`Chr8:53725952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:53726513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr8:53726527`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780609.1

414 aa

207

414

A_deamin

PF02137 A_deamin 58-406 aa

XP_057780610.1

349 aa

174

349

A_deamin

PF02137 A_deamin 2-341 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780609.1`	Pfam	`PF02137`	A_deamin	Family	58	406	1.5e-83	281.7	Adenosine-deaminase (editase) domain
`XP_057780610.1`	Pfam	`PF02137`	A_deamin	Family	2	341	1.7e-77	261.9	Adenosine-deaminase (editase) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924626.1
CAAACCCAAAACGGCGTCGTATGAAATTTGGCATTCCCGCTCAGAAACTCGACACCGGCGACGATGACGTCAACGCCGGAGAACACCGCGGAGAAGCCATGGGCAGAGAAGGTTTCAGAAGCAGTGAATTCGATGTACGATTCTCTCCCCAAGAAAGGGAAGCCTCAAGGCCGCGAAGTCACCGTTTTAGCCGCTTTTATCCTCTCTAATCCTTCGCAAGAATTGCGAGTGGTGGCGCTGGGTACGGGGACGAAGTGTAT...

XM_057924627.1
GGAGAACACCGCGGAGAAGCCATGGGCAGAGAAGGTTTCAGAAGCAGTGAATTCGATGTACGATTCTCTCCCCAAGAAAGGGAAGCCTCAAGGCCGCGAAGTCACCGTTTTAGCCGCTTTTATCCTCTCTAATCCTTCGCAAGTGGCTGGTGTTTCTCTTTTGTATGTATTGTGTGTGAAGAATTGCGAGTGGTGGCGCTGGGTACGGGGACGAAGTGTATGGGGAGATCGCGGTGGAGTTCGCGCGGCGATGTCGTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999128
ATGACGTCAACGCCGGAGAACACCGCGGAGAAGCCATGGGCAGAGAAGGTTTCAGAAGCAGTGAATTCGATGTACGATTCTCTCCCCAAGAAAGGGAAGCCTCAAGGCCGCGAAGTCACCGTTTTAGCCGCTTTTATCCTCTCTAATCCTTCGCAAGAATTGCGAGTGGTGGCGCTGGGTACGGGGACGAAGTGTATGGGGAGATCGCGGTGGAGTTCGCGCGGCGATGTCGTGAACGATTCGCATGCTGAAGTAATCGC...

LOC130999128
ATGGGGAGATCGCGGTGGAGTTCGCGCGGCGATGTCGTGAACGATTCGCATGCTGAAGTAATCGCCAGGCGATCTCTTCTTCGATATTTCTATACAGAGATTGATTGCGTGGCCAAAAAGTATAGGAAGCTTAGCCATGAAAATGGGAGCGCCGTTTTGCCGAATGATGACATGATTGACGCAGTTTTCCAGCTGAGGTCGGATAAACCCGAGCGCGCAAAATTTGAATTGAGACCTGGCTGGCAATTGCATCTGTATGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780609.1
MTSTPENTAEKPWAEKVSEAVNSMYDSLPKKGKPQGREVTVLAAFILSNPSQELRVVALGTGTKCMGRSRWSSRGDVVNDSHAEVIARRSLLRYFYTEIDCVAKKYRKLSHENGSAVLPNDDMIDAVFQLRSDKPERAKFELRPGWQLHLYVSQLPCGDASLNSQMFTSLSSNSPVKPNNECLPLQVSLQNGASFQVPGTVHRKPGRGDTTLSVSCSDKIARWNVVGVQGALLTCFLEPIYISSITVGQSQFDSANIVAD...

XP_057780610.1
MGRSRWSSRGDVVNDSHAEVIARRSLLRYFYTEIDCVAKKYRKLSHENGSAVLPNDDMIDAVFQLRSDKPERAKFELRPGWQLHLYVSQLPCGDASLNSQMFTSLSSNSPVKPNNECLPLQVSLQNGASFQVPGTVHRKPGRGDTTLSVSCSDKIARWNVVGVQGALLTCFLEPIYISSITVGQSQFDSANIVADNLRRSLYERIIPLSNTLTEPFKVNKPHFHVAPVPPKEFQHCETALETLTCGYSICWNRSGLHEVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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