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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004057`

染色体: Chr01 坐标: 59009416-59013737 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004057`
名称	SmilChr01G004057
描述	protein trichome birefringence-like 11
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59009416 - 59013737 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999129`
GeneID	`130999129`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999129`
原始查询	`LOC130999129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 11
产物	protein trichome birefringence-like 11
Arabidopsis	`AT5G19160` (TBL11) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832036] identity=59.1; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0145400` (OsTBL23) - identity=65; qcov=0.808; evalue=4.59e-169; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999129

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057780612.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780612.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780612.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780612.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780612.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59009749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C8
`Chr1:59009753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C8
`Chr1:59009879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B23,C61,C77
`Chr1:59012004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B19,B22,B27
`Chr1:59012040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B19,B22,B27
`Chr1:59012140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:59012640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:59012653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:59012669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B53
`Chr1:59013006`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B123,B134,B65,B8,B89,C10,C15,C57,C64,C66
`Chr1:59013047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,D10
`Chr1:59013141`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780612.1

432 aa

216

432

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 75-127 aa PF13839 PC-Esterase 128-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780612.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	75	127	1.1e-20	74.4	PMR5 N terminal Domain
`XP_057780612.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	128	414	5.2e-97	325.9	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924629.1
GATTTATGTAAAATGCATCTCGTGATTTATCTGTGCGCATACGGGCGGGAAAGTACGGGAAAACATGAAATTTACTAAAGCATATTACAACGTGACATCACTCACTCTCTCTCTCTAGAGCTCTTGATTGTATTTGTCGAGGAGTGAGAATCTAGTAAAGGCAGAGGAGCGAGAATGGAGCTTTACTTTAGCAACTTTCCTGCAATTAGTCTTCCATTGAATACACAACACAACTGCCCCATTCTAACCTCCTCCCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999129
ATGCCCCTTTCCGATTTCTTCAAGAGATTCAAATTCTTGAAACCTCCGGATTCCACGCTCGGCTGCTTCTCTTTCTGCCTCTGCTTGATTCTTTGCTTCTTCCTGCTGAACTACAGCGTTGTCGAGAATTTTCATGGGAACTCGTCGTTGATGATGTGGTTCAAGTCCAACGGTTCGTCGCCGGAAGCGGACAAGGTTGGATTTCTTGAAGCAGGCGGCGATGGGTGCGATGTGTTTAGTGGGAGATGGGAGTGGGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780612.1
MPLSDFFKRFKFLKPPDSTLGCFSFCLCLILCFFLLNYSVVENFHGNSSLMMWFKSNGSSPEADKVGFLEAGGDGCDVFSGRWEWDERYPLYQSRDCAFLDEGFRCSENGRPDNFYTKWRWQPKDCNLPRFDAKVMLEKLRGKRLVFVGDSIGRNQWESLLCMLSSVVPNKTSIYEVNGNPITKHMGFLIFKFRDFNCTVEYYRAPFLVLQSRAPAGAPENVKMTLKLDQMDWSSSQWKGADILIFNTGHWWNNEKTIKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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