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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004422`

染色体: Chr08 坐标: 53923675-53927361 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004422`
名称	SmilChr08G004422
描述	putative threonine aspartase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53923675 - 53927361 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999141`
GeneID	`130999141`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999141`
原始查询	`LOC130999141`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative threonine aspartase
产物	putative threonine aspartase
Arabidopsis	`AT4G00590` (AT4G00590) N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827968] identity=64.5; qcov=0.997; evalue=1.24e-178; confidence=high
Rice	`Os04g0682500` - identity=57.9; qcov=1.05; evalue=1.31e-163; confidence=high
GO	GO:0004298 (threonine-type endopeptidase activity); GO:0051604 (protein maturation)
KEGG	-
Pfam	PF01112 (Asparaginase_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999141

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780624.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780624.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780624.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057780624.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53923786`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	13	A9,B1,B101,B112,B128,B14,B62,B98,C12,C17,C56,C6,C85
`Chr8:53923820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B2,C63,C67,C84
`Chr8:53924511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr8:53924956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr8:53924978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B18,B89,C54
`Chr8:53925019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B137
`Chr8:53925446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B88
`Chr8:53925856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B12,C20
`Chr8:53925875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B14,B2,B93,C75
`Chr8:53925905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A1,A16,A24,A25,A3,A9,B102,B104,B105,B109,B11,B117,B120,B131,B132,B137,B138,B17,B20,B21,B22,B25,B32,B33,B34,B35,B38,B41,B42,B43,B5,B52,B53,B56,B57,B59,B60,B67,B82,B83,B85,B86,B87,B9,B96,B98,C14,C18,C20,C21,C25,C26,C29,C3,C35,C36,C37,C4,C40,C41,C5,C54,C60,C78,C82,C84,D4,D5,D9
`Chr8:53926505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B55
`Chr8:53926880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780624.1

393 aa

196

393

Asparaginase_2

PF01112 Asparaginase_2 11-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780624.1`	Pfam	`PF01112`	Asparaginase_2	Domain	11	311	1.7e-48	166.1	Asparaginase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924641.1
TCTTAATAAACCTATTTAAGTAAAGCTATGATTCACGAGTAGTCCTAAAAAGATACTCACAATGGAGAGCGAAGCAGGCGATCGATTTTTCGTTGCGGTGCACGTCGGCGCGGGGTTCCACTCGCCGTCGAACGAGAAGGCCCTCCGCTCCGCCATGAAACGCGCCTGTCTGGCGGCGGCTTCGCTTCTCCGGAAGGGTTCTGGTGGATGTATTGATGCTGTTGCAGCTGCAATTCAAGTTCTGGAGGATGATCCTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999141
ATGGAGAGCGAAGCAGGCGATCGATTTTTCGTTGCGGTGCACGTCGGCGCGGGGTTCCACTCGCCGTCGAACGAGAAGGCCCTCCGCTCCGCCATGAAACGCGCCTGTCTGGCGGCGGCTTCGCTTCTCCGGAAGGGTTCTGGTGGATGTATTGATGCTGTTGCAGCTGCAATTCAAGTTCTGGAGGATGATCCTTGCACGAATGCTGGGAGAGGATCAAATTTGACTGAGGATGGTCGTGTAGAATGTGATGCCAGTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780624.1
MESEAGDRFFVAVHVGAGFHSPSNEKALRSAMKRACLAAASLLRKGSGGCIDAVAAAIQVLEDDPCTNAGRGSNLTEDGRVECDASLMDGDSGAFGAVGATPGVRNPIQIAALLAKEQISGSSLLGRISPMFLVGEGAHMWAKSKGIATDGTIEEADEWLVTERARIQWKRYKEMLDDAKAREAQSHDLPKVKKSRNQSYSLSTLEEDAILDTVGVICVDSEGHIASGASSGGIALKARGRVGLAAMYGAGCWASSRGPF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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