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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004421`

染色体: Chr08 坐标: 53920321-53923067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004421`
名称	SmilChr08G004421
描述	bifunctional protein FolD 4, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	53920321 - 53923067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999142`
GeneID	`130999142`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999142`
原始查询	`LOC130999142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional protein FolD 4, chloroplastic-like
产物	bifunctional protein FolD 4%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G00620` (EMB3127) Amino acid dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825824] identity=84.1; qcov=0.813; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0120900` - identity=79.1; qcov=0.802; evalue=2.79e-172; confidence=high
GO	GO:0004477 (methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity); GO:0004488 (methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity); GO:0005829 (cytosol); GO:0035999 (tetrahydrofolate interconversion)
KEGG	-
Pfam	PF00763 (THF_DHG_CYH); PF02882 (THF_DHG_CYH_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999142

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780625.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057780625.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780625.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780625.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:53920635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85
`Chr8:53921627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:53921681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:53921837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:53922205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B82,C10,C48,C52
`Chr8:53922678`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:53922681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B76
`Chr8:53922693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B128,B37,B58,C58
`Chr8:53922780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780625.1

364 aa

182

364

THF_DHG_CYH

THF_DHG_CYH_C

PF00763 THF_DHG_CYH 76-191 aa PF02882 THF_DHG_CYH_C 212-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780625.1`	Pfam	`PF00763`	THF_DHG_CYH	Domain	76	191	2.2e-42	144.6	Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, catalytic domain
`XP_057780625.1`	Pfam	`PF02882`	THF_DHG_CYH_C	Domain	212	360	2.8e-63	212.5	Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, NAD(P)-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924642.1
GCATGAAAATATACCATTATTTCATGCGAAAAAGGAAATTTCAACATGAAACGGCGTCGTTGCCTGCAAAATCTTCTTCGTTGTCCACCTTCATCACAAGGTAAAAAAAATATCAGAAAATAGGAAACCTCAGAATCCAGCTTTAACAGAACCCTACTTTTTCCTTTTCCGCTTTATAATCATTTCTAAAACCCTAATTCTCATTCATCCATTCATATATCAAAGCAAGAGCAGAAGAGCAAGCATAGGGCTGAGATTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999142
ATGGCATCCTCCGCCGCCACCTCCTCCGCCGCCGCTATGTTCGGCACCGCCGCCGCCTCAGATGGCTGCGCACGCCGAGTTTTCGTTACGACCACCGTCCAGCTGCGCGCCTCCCGGAGCTCTCCCGCCTTCCTGAGAACGAGTGGAGCTATCAACACTTACGCCTCCTGCAGCAATTCGTCCGTTGTCAATGCTGCATTGACTACTGAGGCATCTGCTAAGGTTATTGATGGGAAAGCGACTGCCAAAGAGATCAGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780625.1
MASSAATSSAAAMFGTAAASDGCARRVFVTTTVQLRASRSSPAFLRTSGAINTYASCSNSSVVNAALTTEASAKVIDGKATAKEIREEIAAEISKMKESSGVVPGLAVILVGERKDSATYVRNKKKACDTVGIKSYEVHLAEDSSEQEVLEHISCFNDDPAVNGILVQLPLPSHMNEQNILNAVCIEKDVDGFSPLNIGRLAMRDREPLFVPCTPKGCIELLHRYGVPIKGKRAVVIGRSNIVGMPAALLLQREDATVTV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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