当前解析结果
SmilChr08G004436| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004436 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004436 |
| 描述 | BON1-associated protein 2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 54057763 - 54058441 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999161 |
|---|---|
| GeneID | 130999161 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999161 |
| 原始查询 | LOC130999161 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BON1-associated protein 2-like |
| 产物 | BON1-associated protein 2-like |
| Arabidopsis | AT2G45760 (BAP2)BON association protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819184] identity=40.5; qcov=1.18; evalue=4.6e-28; confidence=medium |
| Rice | Os09g0526500- identity=41.6; qcov=0.806; evalue=1.69e-12; confidence=low |
| GO | GO:0006952 (defense response) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00168 (C2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999161 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780643.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057780643.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057780643.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780643.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780643.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:54057833 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr8:54057893 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A2,B133,C32,D5 |
Chr8:54057897 |
GGC |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 46 | A14,A24,A6,A8,B105,B11,B111,B125,B134,B137,B17,B18,B22,B27,B40,B49,B52,B53,B58,B59,B68,B74,B78,B84,B86,B89,B93,C11,C16,C24,C25,C26,C27,C29,C33,C36,C37,C54,C57,C61,C65,C69,C75,C79,C8,D1 |
Chr8:54057968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr8:54058012 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,A2,B133,D2,D5 |
Chr8:54058025 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B134 |
Chr8:54058079 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B8,C51,C57 |
Chr8:54058284 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B76,B99 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057780643.1PF00168
C2 14-98 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057780643.1 |
Pfam | PF00168 |
C2 | Domain | 14 | 98 | 8.9e-05 | 23.4 | C2 domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。