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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004442`

染色体: Chr08 坐标: 54135920-54139320 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004442`
名称	SmilChr08G004442
描述	probable pectin methyltransferase QUA3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54135920 - 54139320 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999165`
GeneID	`130999165`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999165`
原始查询	`LOC130999165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable pectin methyltransferase QUA3
产物	probable pectin methyltransferase QUA3
Arabidopsis	`AT4G00740` (QUA3) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828020] identity=77.7; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0569400` (OSJNBb0032E06.12) - identity=64.5; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0008168 (methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03141 (Methyltransf_29); PF08241 (Methyltransf_11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999165

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057780649.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057780649.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780649.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780649.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54136233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:54136284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B7,B80
`Chr8:54136338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:54136927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:54137136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C46
`Chr8:54138158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B65,C59
`Chr8:54138641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B87,C24,D10
`Chr8:54138649`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr8:54138649`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr8:54138759`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B36
`Chr8:54138759`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780649.1

597 aa

298

597

Methyltransf_29

Methyltransf_11

PF03141 Methyltransf_29 87-587 aa PF08241 Methyltransf_11 204-299 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780649.1`	Pfam	`PF03141`	Methyltransf_29	Family	87	587	1.7e-208	694.0	Putative S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase
`XP_057780649.1`	Pfam	`PF08241`	Methyltransf_11	Domain	204	299	2.6e-09	38.3	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924666.1
AAATTAGAATAACATAACATGAAACCCACGCAAGTTGTGGAACTAACCGTGGCCATTATTTTAGATTTTTAGCTTCAATTTCACTCTTTGAAGTTATTGTACATTACGCAGCGTAGCTTGTACCACATCAACTCCTAATTGGCCAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATAGGATATTGAAAAACAGCGAGCTTGAATCTTGACAGCCAGTAGTGCAGCCTCGGACTTGAGATCTTCAAGAAACACAGTGACACTCCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999165
ATGGGCCTCTTGAATCTGCCGTCTTCCAAGCACCGGCACGCGCGCCAATGGCGGCTGCTGGATGCAATCGTGGCCGCCTTCTTCGCGGCGGTTCTGCTCTTCTTCCTCCTAGTCTTCACTCCGCTGGGGGACTCGCTGGCGGCGTCGGGGCGGCAGACGCTGCTGCGGTCGGATCCGCGCCACCGGGGGCGGTTGGTGGCGCTGGTGGAGCACGGGCGGCAGGCGGTGGCGATCGACGCTTGCCCCGCCGATATGGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780649.1
MGLLNLPSSKHRHARQWRLLDAIVAAFFAAVLLFFLLVFTPLGDSLAASGRQTLLRSDPRHRGRLVALVEHGRQAVAIDACPADMVDHMPCEDPRINSQLSRDMNFYRERHCPRPEETPLCLIPPPDGYKVPVQWPESLHKIWHNNMPYNKIADRKGHQGWMKREGPYFIFPGGGTMFPDGAEQYIEKLKQYIPIAGGALRTALDMGCGVASFGGYMLSEGILTLSFAPRDSHKAQIQFALERGVPTFVAMLGTRRLPFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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