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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004454`

染色体: Chr08 坐标: 54263289-54268094 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004454`
名称	SmilChr08G004454
描述	FT-interacting protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54263289 - 54268094 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999178`
GeneID	`130999178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999178`
原始查询	`LOC130999178`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FT-interacting protein 3-like
产物	FT-interacting protein 3-like
Arabidopsis	`AT4G11610` (AT4G11610) C2 calcium/lipid-binding plant phosphoribosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826766] identity=63.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0683800` - identity=66.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2); PF08372 (PRT_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057780661.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780661.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057780661.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057780661.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057780661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54264974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:54265394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:54265515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C67
`Chr8:54265639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B86
`Chr8:54265675`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr8:54265675`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr8:54265739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,B88
`Chr8:54266366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B16,B94,B97,C13,C40
`Chr8:54267389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:54267425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr8:54267726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C62
`Chr8:54267737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B54,B92,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780661.1

1009 aa

504

1009

PRT_C

PF00168 C2 5-96 aa PF00168 C2 276-378 aa PF00168 C2 438-542 aa PF00168 C2 600-709 aa PF08372 PRT_C 854-1009 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780661.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	5	96	3e-82	272.3	C2 domain
`XP_057780661.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	276	378	3e-82	272.3	C2 domain
`XP_057780661.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	438	542	3e-82	272.3	C2 domain
`XP_057780661.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	600	709	3e-82	272.3	C2 domain
`XP_057780661.1`	Pfam	`PF08372`	PRT_C	Family	854	1009	2.6e-79	265.2	Plant phosphoribosyltransferase C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924678.1
AAAAAGAAACATGAAAACACACACACACACACACGTACGTTGGAAACAGACAACAGTATACGTCCAAGACTTTTCCACTTTCTCATTTCTTGCTCATCTTCTTCCTTGAATTTTCTTCTCTCTCTCTAACTCCCTTTTATTTATTATGCATATAGACAGGAGCCCTGCTTCTCCATTATTACTACTGTTAGACTTTCAACCCCTTTCTTCAACACCATAAATTCTTTCCATCTCTCACCTCGTCTTCTTTCTTCCTTACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999178
ATGAGCAATCTCAAGCTAGGTGTAGAGGTTGTAAGAGCCCACAACCTTTTGCCCAAAGATGGGCAGGGCTCGTCTAGTCCATTCGTGGAGCTTCATTTTGATGGTCAGAGATTCCACACCACGGTAAAAGAAAAGGACCTCAACCCATTCTGGAATGAGGCATTCTATTTCAATGTGTCGAATCCTGATAACCTGCACAATCTCATCCTTGAGGCTCACGTCTACAACATCAACATAACCACCAAGTCAAAATCTTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780661.1
MSNLKLGVEVVRAHNLLPKDGQGSSSPFVELHFDGQRFHTTVKEKDLNPFWNEAFYFNVSNPDNLHNLILEAHVYNINITTKSKSSLGKVRLTSTSFIPHADAVVFNYPLEKGNLFTRARGELGMKVFVTNDPSIRPSVPLPETASLSSHSSVHPSSHADHLPSEKVEEAVSGTSAKGKRGSIRTFFHLPNSSSQRQQPPPTGSQKSNVHGVDEMRSHPQVPQAYGMYANSSLHPADFSLKETSPFLGGGQVIGGRVRRS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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