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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004490`

染色体: Chr08 坐标: 54529348-54533700 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004490`
名称	SmilChr08G004490
描述	salviol synthase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54529348 - 54533700 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999213`
GeneID	`130999213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999213`
原始查询	`LOC130999213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	salviol synthase-like
产物	salviol synthase-like
Arabidopsis	`AT3G26300` (CYP71B34) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 34 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822234] identity=41.1; qcov=1; evalue=1.59e-127; confidence=medium
Rice	`Os03g0593600` (CYP71W1) - identity=44.7; qcov=0.992; evalue=3.8e-139; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057780701.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057780701.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780701.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780701.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780701.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54529488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B103,B72,C60
`Chr8:54529512`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr8:54529512`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr8:54529548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C78,C8
`Chr8:54529559`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B131,C30,C35
`Chr8:54529571`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A10,A20,B16,B18,B27,B33,B54,B67,B69,B72,B78,B85,B99,C10,C14,C23,C48,C49,C52,C75,C76,C8,C82,D1,D10,D8
`Chr8:54529576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B94
`Chr8:54529578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B131,C30,C35
`Chr8:54529584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:54529623`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:54529749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B40
`Chr8:54529752`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780701.1

494 aa

247

494

p450

PF00067 p450 33-482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780701.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	33	482	2.4e-91	307.5	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924718.1
GTGAAACACAATGTAATGCAATAATCTCATCCCCTATAAATACACGAGAAAGAAATGATCAAGTATACACATCTCATAAATTCCAATTTCCAAAACTCAAAATCCCTTCTTTAATTGTAGCCCTCCCTCATGGACTTCGAGTACTATTCTATCCTCCTCCTTATTACCACTTTCGTGTTCGTGTTCTTGTTCGTGTTCGTGTTTCATAAGCCGAATAAAAATCTCCCCCCGGGGCCGCGCAAGTTGCCTTTTATAGGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999213
ATGGACTTCGAGTACTATTCTATCCTCCTCCTTATTACCACTTTCGTGTTCGTGTTCTTGTTCGTGTTCGTGTTTCATAAGCCGAATAAAAATCTCCCCCCGGGGCCGCGCAAGTTGCCTTTTATAGGCAACTTGCACCTCCTCGCCGGCTCCGCTCCGCCCCACCACACTCTTGCAAACTTGGCCGCCGAATACGGACCCTTGATGCACCTAAAATTAGGTGAAACCGACGCCGTAGTCGTCTCCTCACCGGAAACCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780701.1
MDFEYYSILLLITTFVFVFLFVFVFHKPNKNLPPGPRKLPFIGNLHLLAGSAPPHHTLANLAAEYGPLMHLKLGETDAVVVSSPETAKLFLKENDVVFASRPSLLAPEINCYGNTDIAFAPYGDYWRQLRKICSLQLFTAKRVQSFRPIREEEVADLCKSVALNAGSTINLTENIGTTNLNIMVRAAFGKKGGGEICEQNSIIKEAQEFLTCFNLVDVYPSMRFLKLFSGMKRKIEKHHRKLNRITESIIEERRRAHHDR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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