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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004495`

染色体: Chr08 坐标: 54581362-54583242 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004495`
名称	SmilChr08G004495
描述	thioredoxin-like 1-2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54581362 - 54583242 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999217`
GeneID	`130999217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999217`
原始查询	`LOC130999217`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like 1-2, chloroplastic
产物	thioredoxin-like 1-2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G08570` (ACHT4) atypical CYS HIS rich thioredoxin 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837379] identity=69; qcov=0.622; evalue=3.05e-82; confidence=high
Rice	`Os07g0684100` - identity=67.6; qcov=0.64; evalue=2.72e-82; confidence=high
GO	GO:0045454 (cell redox homeostasis)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780704.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057780704.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780704.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780704.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780704.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54581723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:54581735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B110,B53,B74
`Chr8:54582007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B67,C49,C8,C87,D11
`Chr8:54582423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:54582732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B108,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780704.1

275 aa

138

275

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 106-185 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780704.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	106	185	3.8e-11	43.6	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924721.1
AGGGCTGATGACAAATCTATTGACCCCACCTGCTTCGCTTTGCTTCTTTTTCTCTTTATCCACAGCGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCCACGCCATTTCTCTCACTTCCCCTTTACGTTTTCTCTCTTCCGAAGCTTCAAATTCACAAAATCACATAGACCTTTTTTCAATTTTTGATCCCAAACTTTTTTCTCTCTAGAATAGAGAATCAATTTAGAAGAACAAACGACCGTATTCATATTTCTTGAAAAGTCTGTTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999217
ATGTCGTGTCTACCCGCCGGCTTCTCTGTTTCTGGCTCGAGCAGTCCGATTTTCAACAATCGAGAAAGAGGGTCGTCTCTGTCTTCTAGGGTTTGCTCTTCAATTGGGGGTTTGCAATTTAGGGGCTCCAATTCGAAGGAAATTTGGGGCAACACTCTCGATTTCCCAGATCAGAAAGGCTTCAGCAATTGGAGCAACAAATCCCCAAATTTGGACCCTGTTTATGCACAAGGAACACTTTCATTTCCAAAAAAAGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780704.1
MSCLPAGFSVSGSSSPIFNNRERGSSLSSRVCSSIGGLQFRGSNSKEIWGNTLDFPDQKGFSNWSNKSPNLDPVYAQGTLSFPKKAQKWWEKSLQPNMVEIESAQELVEYLRNAGDRLVVLNFFSPGCGGCKALHPKICQLAESNSNTIFLTVNYEEHKPMCYALHVHVLPFFRFYRGADGKVCSFSCTNATIKKFKDALAKHGTERCSLGPAKGLEEKELLALASIDLISKDLVPLSSPEEEKVQELVEAAKSSSFSID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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