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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004496`

染色体: Chr08 坐标: 54589692-54591668 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004496`
名称	SmilChr08G004496
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54589692 - 54591668 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999218`
GeneID	`130999218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999218`
原始查询	`LOC130999218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4, chloroplastic
产物	photosynthetic NDH subunit of subcomplex B 4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G18730` (PnsB4) NDH dependent flow 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838455] identity=61.2; qcov=1.01; evalue=1.78e-71; confidence=high
Rice	`Os02g0744000` - identity=64.4; qcov=0.825; evalue=5.66e-54; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0010598 (NAD(P)H dehydrogenase complex (plastoquinone))
KEGG	-
Pfam	PF28701 (PnsB4_N); PF28702 (PnsB4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780705.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057780705.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.80000	`XP_057780705.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780705.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54589913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:54590740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B58,B70,C41,C53,D4
`Chr8:54591007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:54591482`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B130
`Chr8:54591482`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780705.1

180 aa

180

PnsB4_N

PnsB4_C

PF28701 PnsB4_N 67-113 aa PF28702 PnsB4_C 134-175 aa

XP_057780706.1

177 aa

177

PnsB4_N

PnsB4_C

PF28701 PnsB4_N 64-110 aa PF28702 PnsB4_C 131-172 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780705.1`	Pfam	`PF28701`	PnsB4_N	Domain	67	113	4.2e-33	113.5	PnsB4 N-terminal domain
`XP_057780705.1`	Pfam	`PF28702`	PnsB4_C	Domain	134	175	7.2e-23	81.2	PnsB4 C-terminal domain
`XP_057780706.1`	Pfam	`PF28701`	PnsB4_N	Domain	64	110	4.1e-33	113.6	PnsB4 N-terminal domain
`XP_057780706.1`	Pfam	`PF28702`	PnsB4_C	Domain	131	172	7e-23	81.2	PnsB4 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924722.1
GGGCAATACAGTCAATTCCGACACAAGAAGCAATAATATCTAATAAGCCCAACTTTGTCTTGGTTCTTACAAATTCATAGGTGGATATAAATGGTAGTCTTATCCATTTCCTTATAACCAAACAAAAAAATGTAAATAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACATCTCATTCTTCAACCTTAGGGAGAAATGGCTGAAACTCTCACTTCCCTAACACTTCTGCAGCCTTGCATCAAGCAAAGTTCTCAACAAACAACTAAGGCTC...

XM_057924723.1
GTCTTATCCATTTCCTTATAACCAAACAAAAAAATGTAAATAAAAAAGAAAAAGAAAAAAACATCTCATTCTTCAACCTTAGGGAGAAATGGCTGAAACTCTCACTTCCCTAACACTTCTGCAGCCTTGCATCAAGCAAAGTTCTCAACAAACAACTAAGGCTCAATTCACCTCACTTTCTAAATCAAGCTCAAGTTCAAGGTTTTACAAGATTAAAGATGAAAGAAGAAGATCGTTGGTTCGTGCGAACGCGTTGCCCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999218
ATGGCTGAAACTCTCACTTCCCTAACACTTCTGCAGCCTTGCATCAAGCAAAGTTCTCAACAAACAACTAAGGCTCAATTCACCTCACTTTCTAAATCAAGCTCAAGTTCAAGGTTTTACAAGATTAAAGATGAAAGAAGAAGATCGTTGGTTCGTGCGAACGCGTTGCCCGATTGGCCGTTGATGGCAGTTATGGTTGAACACATGGAAGGGCAAAGAGACCTCATCACACACAAGTCAATTTGGCATCTCAGTGATCA...

LOC130999218
ATGGCTGAAACTCTCACTTCCCTAACACTTCTGCAGCCTTGCATCAAGCAAAGTTCTCAACAAACAACTAAGGCTCAATTCACCTCACTTTCTAAATCAATTAGGCAGAGCTCAAGTTCAAGGTTTTACAAGATTAAAGATGAAAGAAGAAGATCGTTGGTTCGTGCGAACGCGTTGCCCGATTGGCCGTTGATGGCAGTTATGGTTGAACACATGGAAGGGCAAAGAGACCTCATCACACACAAGTCAATTTGGCATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780705.1
MAETLTSLTLLQPCIKQSSQQTTKAQFTSLSKSIRQSSSSRFYKIKDERRRSLVRANALPDWPLMAVMVEHMEGQRDLITHKSIWHLSDQAIKNVYTFYIMFTVWGCCFFGSTKDPFYDSEGYRGDGGDGTGHWIYEKQEDMEELARAELWREELIEEIEQKVGGLRELEEAGKKEELVK

XP_057780706.1
MAETLTSLTLLQPCIKQSSQQTTKAQFTSLSKSSSSSRFYKIKDERRRSLVRANALPDWPLMAVMVEHMEGQRDLITHKSIWHLSDQAIKNVYTFYIMFTVWGCCFFGSTKDPFYDSEGYRGDGGDGTGHWIYEKQEDMEELARAELWREELIEEIEQKVGGLRELEEAGKKEELVK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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