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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004503`

染色体: Chr08 坐标: 54630373-54634743 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004503`
名称	SmilChr08G004503
描述	polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase NOL9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54630373 - 54634743 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999225`
GeneID	`130999225`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999225`
原始查询	`LOC130999225`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase NOL9
产物	polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase NOL9
Arabidopsis	`AT5G11010` (AT5G11010) Pre-mRNA cleavage complex II protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830968] identity=58.3; qcov=1; evalue=9.62e-158; confidence=high
Rice	`Os01g0184000` - identity=53.9; qcov=0.914; evalue=1.71e-127; confidence=high
GO	GO:0000448 (cleavage in ITS2 between 5.8S rRNA and LSU-rRNA of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005634 (nucleus); GO:0051731 (polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF16575 (CLP1_P); PF25467 (NOL9_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999225

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780713.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057780713.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780713.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780713.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780713.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54631077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C49
`Chr8:54631432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C9
`Chr8:54632261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C50
`Chr8:54632528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:54632583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B19,C76,D8
`Chr8:54632603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B69,C1,D1
`Chr8:54633458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:54634427`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780713.1

370 aa

185

370

CLP1_P

NOL9_C

PF16575 CLP1_P 41-237 aa PF25467 NOL9_C 259-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780713.1`	Pfam	`PF16575`	CLP1_P	Domain	41	237	5.6e-38	131.4	mRNA cleavage and polyadenylation factor CLP1 P-loop
`XP_057780713.1`	Pfam	`PF25467`	NOL9_C	Domain	259	348	6.8e-34	116.5	NOL9-like, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924730.1
AATTTAGGAAATCCTTTTCTAACTCTTACGAATATCAATACAATAATCAATAAAAATAAAAATATTAATTAAATTTCGAGTTCGACACACCAAAACTTCACGCCGCCGGCGTGTCCAGTCCAGCTGCCACCGTACCTTCCCAAAACCCCCACCTTTTTTAAACCCACGGCGGCCGCATAATTCCTGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAGAGGGGAAGAGCGAAATCATCATCACTTCTTAAGCATGGCGGCAGCTTCAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999225
ATGGCGGCAGCTTCAGAAACCGAGAGCCTGCAACCGGAAATCATTATTCCCGATGAGTGGTCGAACGCAGCCGGCGCGATAGCCAGCGGCGCTGTTTCTTTTCCTATTGCTTTTGTCTGCGGCCCCAAAAACAGCGGGAAAACAACTTTCGCCCGCCACCTCGTTAATGTCCTTCTCCAGAGGCACAAAAGGGTGGCTTTTCTTGATACTGATGTTGGGCAGACGGAGTTTACTCCGCCTGGTCTCCTAGCACTGACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780713.1
MAAASETESLQPEIIIPDEWSNAAGAIASGAVSFPIAFVCGPKNSGKTTFARHLVNVLLQRHKRVAFLDTDVGQTEFTPPGLLALTVIDKITPDLTIPCVKTPARCFFFGDISSKRDPTTYLTYIKALYDHYMETEIQGAGLPLVINTPGWVKGIGYEILVEMLRYISATHVVKLQRPVSTKNLPDGAFWLNEGDADADAVTTVIEINAPPQNHFSSSAPMRKDARLLRDLRVMAYFRQCFPSDMIISTIKELSHALAAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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