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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004519`

染色体: Chr08 坐标: 54785855-54789043 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004519`
名称	SmilChr08G004519
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	54785855 - 54789043 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999238`
GeneID	`130999238`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999238`
原始查询	`LOC130999238`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35; qcov=0.57; evalue=1.99e-67; confidence=medium
Rice	`Os07g0186500` - identity=32.2; qcov=0.734; evalue=5.5e-70; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999238

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057780730.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057780730.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057780730.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780730.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:54786151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C30
`Chr8:54786255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C32,C9
`Chr8:54786256`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,C82
`Chr8:54786256`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr8:54786288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,B81,B89
`Chr8:54786327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B13,B81,B89
`Chr8:54786331`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A11,A18,A6,B105,B106,B12,B125,B134,B22,B25,B28,B37,B38,B39,B54,B57,B61,B62,B65,B66,B71,B81,B86,B90,B92,B95,C17,C21,C28,C36,C42,C46,C48,C55,C60,C62,C70,C72,C75,C81,C9
`Chr8:54786376`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:54786386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr8:54786388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B51,C35
`Chr8:54786388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B51,C35
`Chr8:54786459`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780730.1

862 aa

431

862

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 154-323 aa PF23559 WHD_DRP 407-478 aa PF23598 LRR_14 541-844 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780730.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	154	323	1.5e-42	145.9	NB-ARC domain
`XP_057780730.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	407	478	2e-18	66.9	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057780730.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	541	844	1.8e-13	50.7	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924747.1
GGTCTCTATTTATAGAAAATAAAAAAATATAAATTTTGATATTTTTAATTATTTTTTAAATATTTATATTAAAAATATACTAATTTTTTATTAATTATCCCAACAAAATCTACTTAACCAATCAAATATTGACAAATCGTTGCACCATTGATCCAAACTAGATGAGAGAGAGTGATCACTCCCCAATTTTCCTACCGACAAAGATGGTCTTAATAATGGCAGCCATATTTACTGAACACCACTTTCCTTTCCTTTTGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999238
ATGGCTTACAATCTTCAATCACTCATCACCATCCTCCATGGGATTCTGGATCCCGAACAAACACGCTGGAATCTTGGACGTGAGAAACCACAACTCCAATCCCTCCTCGAAAAAGCTTCTTACCTGCAGCAGCAGATTCTCGAAAAAACTCCACTACTCTCCAAAATACCAAGCTTGGAGTGCCAAATCAGAGACGTAGCAAATGAAGCAGAAGACATCGTTGAATCTCACATGGTTAGACGAATTTTCTCGATGCATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780730.1
MAYNLQSLITILHGILDPEQTRWNLGREKPQLQSLLEKASYLQQQILEKTPLLSKIPSLECQIRDVANEAEDIVESHMVRRIFSMHESYMLEQLFSMPEEEEEDTTPDVLLVTQKLDSVIEQVVKLVEVETNKKPTGSSVSGASFSSVVVGVDEDLMQLKDRLIGMQSKLEVLPIVGMGGIGKTTLARKLYQDPLILDHFSYLAWTTISQDYNMRSILLSLLRCITGSDYEHEGDGELKDILYRSLCGRRYMIVLDDIWS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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