当前解析结果
SmilChr01G004082| 统一新 Gene ID | SmilChr01G004082 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G004082 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G004082 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 59227164 - 59228256 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130999298 |
|---|---|
| GeneID | 130999298 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999298 |
| 原始查询 | LOC130999298 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | heat shock protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821824]; symbol=AT3G22530; hit=AT3G22530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | heat shock protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821824]; symbol=AT3G22530; hit=AT3G22530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G22530 (AT3G22530)heat shock protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821824] identity=48.8; qcov=1.05; evalue=1.55e-39; confidence=medium |
| Rice | Os07g0173100- identity=54.9; qcov=0.866; evalue=2.45e-37; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999298 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057780793.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057780793.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057780793.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057780793.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780793.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:59227355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A16,A18,C71 |
Chr1:59227418 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,A18,C71,D11 |
Chr1:59227616 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。