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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004702`

染色体: Chr08 坐标: 56464983-56467907 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004702`
名称	SmilChr08G004702
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56464983 - 56467907 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999307`
GeneID	`130999307`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999307`
原始查询	`LOC130999307`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-4
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35.7; qcov=0.532; evalue=1.32e-68; confidence=medium
Rice	`Os07g0186500` - identity=28.9; qcov=0.901; evalue=1.22e-75; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999307

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780805.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780805.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780805.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780805.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56465089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B110
`Chr8:56465125`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B107,B24,B71,C45,D9
`Chr8:56465133`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:56465133`	`G`	`GGC`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56465157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:56465171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:56465291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B48,B77
`Chr8:56465353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C45
`Chr8:56465383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:56465507`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr8:56465627`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B128,B20,B44,B64
`Chr8:56465642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B51,B78,B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780805.1

912 aa

456

912

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF00931 NB-ARC 170-335 aa PF23559 WHD_DRP 419-490 aa PF23598 LRR_14 553-841 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780805.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	170	335	6e-43	147.1	NB-ARC domain
`XP_057780805.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	419	490	2.4e-21	76.2	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057780805.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	553	841	1.6e-15	57.5	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924822.1
AAATAAAACGACTTGATTACTTATTTCTTTACGTCAATCGTCGTTCAGATTCCTCAAATTTCAACAAAATTCGACTTTGATTTGAGATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATCATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAATTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAGAAGGCTGATGGCTTGCTCAACTTGATAACCAACACTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999307
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATCATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAATTGTATTCGACAAGAAACAGATTGAATCCATTGGGGAGAAGGCTGATGGCTTGCTCAACTTGATAACCAACACTAATATTGATGGAGGTAGCAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCACACATTGTCGATCAAATTCATGCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780805.1
MAAYAALVSVMNIIEQMMSHPRLSIVFDKKQIESIGEKADGLLNLITNTNIDGGSKEASDLESQIASAAHAAEDVIESHIVDQIHAEKKQARTNFMLRLWQRRNRPSHKCSLSDLQQIIEEMDGIKRKGAELKEKWRAREEQATHGDMDVVEEKQPLTTTTGKASPVGLEDDVIHIMDKLTIHQPEQHIISIVGMGGMGKTTLALNVYENSLIQRHFDIRAWATVSQQYSAQEIFSKLLSSIGQSGSGNDLEVELHQTLW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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