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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004626`

染色体: Chr08 坐标: 55806732-55809911 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004626`
名称	SmilChr08G004626
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55806732 - 55809911 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999311`
GeneID	`130999311`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999311`
原始查询	`LOC130999311`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
产物	putative late blight resistance protein homolog R1B-16
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=35.06; qcov=0.558; evalue=4.87e-70; confidence=medium
Rice	`Os11g0633500` - identity=32.84; qcov=0.51; evalue=6.7e-73; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23559 (WHD_DRP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999311

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057780809.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55806840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:55806841`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr8:55806841`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr8:55806862`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C53
`Chr8:55806862`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C53
`Chr8:55806863`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr8:55806863`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr8:55806870`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B22,B83
`Chr8:55806870`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B22,B83
`Chr8:55807034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr8:55807137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr8:55807139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B39,C55,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780809.1

855 aa

428

855

NB-ARC

WHD_DRP

PF00931 NB-ARC 155-320 aa PF23559 WHD_DRP 404-475 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780809.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	155	320	9e-42	143.3	NB-ARC domain
`XP_057780809.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	404	475	4.4e-21	75.4	Disease resistance protein Winged helix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924826.1
GAGATCCCTTCGGAGGTGGGAGAGATAAACACGCTCAAACTCATTCATTTGCATCACTGCTCTGGATCTGCGGCCATTTCAGCATTGGAGATTAAGAAAGAGAAAGAGAGCTTTGGGAAATGATAGTTTCTGGACTCCGTCAAAGACGCCGGCGCAACTTAGCATAACCATCTTTCAGATTCATCAAATTTCAATTACAGTCTGCTGCTTAATCGAAGGATTTGAGATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780809.1_45902
ATGGCAGCTTATGCAGCTCTGGTTTCTGTGATGAACATCATTGAGCAGATGATGAGCCATCCTCGCCTTTCAACTGCTCTCGACAAGAAACAGATTGAATCCCTTGGGGCAAAGGCTGATGGCTTGCTCGAATTGATTACCAACACTAATATTGACGGAGGTAACAAAGAAGCATCAGATCTGGAGAGTCAAATCGCATCTGCAGCTCACGCAGCTGAAGATGTGATTGAATCGCACATTGTCGATCAAATTCCTGCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780809.1
MAAYAALVSVMNIIEQMMSHPRLSTALDKKQIESLGAKADGLLELITNTNIDGGNKEASDLESQIASAAHAAEDVIESHIVDQIPAGSCQASHGCSLLDLQQIIEEMDGIMRKGAELKEKWRAREEQAAHDDMDVVEEKQPLTTTTGKASPVGLEDDVISIMDKLTIHQPKQQIISIVGMGGMGKTTLALNVYENSFIMEHFDIRAWATVSQQYSAKEIFSKLLSSIGQSGNENDLGLKLHQTLCGRRYLIVLDDIWSVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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