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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004670`

染色体: Chr08 坐标: 56195573-56199167 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004670`
名称	SmilChr08G004670
描述	endoglucanase 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56195573 - 56199167 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999334`
GeneID	`130999334`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999334`
原始查询	`LOC130999334`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoglucanase 5-like
产物	endoglucanase 5-like
Arabidopsis	`AT1G48930` (GH9C1) glycosyl hydrolase 9C1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841315] identity=66.9; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674800` (OsGH9C1) - identity=57.4; qcov=0.966; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00759 (Glyco_hydro_9); PF09478 (CBM49)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999334

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057780831.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057780831.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780831.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780831.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780831.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56195903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B109,B25
`Chr8:56195918`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr8:56195936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B109
`Chr8:56195971`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C46
`Chr8:56195971`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C46
`Chr8:56196464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B96,C80
`Chr8:56196518`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,B56,B96
`Chr8:56196524`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:56196543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:56196656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:56196706`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B101,B117,C22,D6
`Chr8:56196742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780831.1

622 aa

311

622

Glyco_hydro_9

CBM49

PF00759 Glyco_hydro_9 30-488 aa PF09478 CBM49 531-609 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780831.1`	Pfam	`PF00759`	Glyco_hydro_9	Repeat	30	488	6e-161	537.3	Glycosyl hydrolase family 9
`XP_057780831.1`	Pfam	`PF09478`	CBM49	Domain	531	609	4e-22	79.0	Carbohydrate binding domain CBM49

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924848.1
TACAAAAAACCTACATATCTCCTAAGTACTTCCTAACTAAAACCCAAAGCCAAGAAATGGCAACCTCAACACCTTCACACGCCATTTTAGTCCTCTTACTCGGCCTAGCCGCTGTCGGGGCGGCCGCAGTCGACTCGTTCGACTATGGGGCCGCCCTCGACAAGACCTTTCTCTTCTTCGAGGCACAGAGATCCGGTAAATTACCTTCCACCCAACGCGTGAAGTGGCGCGGTAACTCGGGCCTTGGCGACGGATTTCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999334
ATGGCAACCTCAACACCTTCACACGCCATTTTAGTCCTCTTACTCGGCCTAGCCGCTGTCGGGGCGGCCGCAGTCGACTCGTTCGACTATGGGGCCGCCCTCGACAAGACCTTTCTCTTCTTCGAGGCACAGAGATCCGGTAAATTACCTTCCACCCAACGCGTGAAGTGGCGCGGTAACTCGGGCCTTGGCGACGGATTTCCTCAAGGGGTGAATTTGGTGGGAGGATACTATGATGCCGGAGACCACGTAAAATTTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780831.1
MATSTPSHAILVLLLGLAAVGAAAVDSFDYGAALDKTFLFFEAQRSGKLPSTQRVKWRGNSGLGDGFPQGVNLVGGYYDAGDHVKFGLPMAFSVTMLSWAAVDFKEDFMKLNQMGQILEAIKWGTDYFIKCHPQQNVLWGQVGDGASDHYCWQRAEDMTTSRTAYKLDAEHPGSDLAGETAAALAAASLAFKPFDSAYSSLLLVHAKQIFSFADTFRGLFIDSIGNAKQFYTSSGYHDELLWAATWLHRATNDEYYLKYA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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