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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004671`

染色体: Chr08 坐标: 56200566-56215899 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004671`
名称	SmilChr08G004671
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56200566 - 56215899 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999335`
GeneID	`130999335`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999335`
原始查询	`LOC130999335`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
产物	phytyl ester synthase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G41130` (AT5G41130) Esterase/lipase/thioesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834115] identity=49.1; qcov=0.949; evalue=3.01e-175; confidence=high
Rice	`Os01g0362100` - identity=44.6; qcov=0.949; evalue=9.69e-158; confidence=medium
GO	GO:0008374 (GO:0008374); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03982 (DAGAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999335

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057780832.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057780833.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057780836.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780832.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56200639`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,C66
`Chr8:56200764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:56200769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,B140,B9,C34,C5
`Chr8:56200794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr8:56201000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C50
`Chr8:56201001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,D10
`Chr8:56201024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:56202095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr8:56202166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B54,B78
`Chr8:56202433`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	46	A1,A18,A20,A8,B103,B104,B107,B11,B112,B12,B122,B124,B129,B13,B135,B138,B19,B26,B29,B33,B38,B40,B49,B50,B58,B60,B62,B63,B69,B76,B8,C11,C14,C32,C41,C43,C47,C49,C51,C68,C69,C74,C75,C76,C83,D5
`Chr8:56202446`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B111,B45
`Chr8:56202446`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B111,B45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780832.1

621 aa

310

621

DAGAT

PF03982 DAGAT 418-494 aa

XP_057780833.1

620 aa

310

620

DAGAT

PF03982 DAGAT 417-493 aa

XP_057780834.1

618 aa

309

618

DAGAT

PF03982 DAGAT 415-491 aa

XP_057780836.1

567 aa

284

567

DAGAT

PF03982 DAGAT 418-494 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780832.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	418	494	4.4e-08	33.1	Diacylglycerol acyltransferase
`XP_057780833.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	417	493	4.5e-08	33.1	Diacylglycerol acyltransferase
`XP_057780834.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	415	491	4.4e-08	33.1	Diacylglycerol acyltransferase
`XP_057780836.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	418	494	3.9e-08	33.3	Diacylglycerol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093473.1
TCCCATCCATGGCGACTATTGTAGTAAATATTGGGCTTTGCCCCACCGGTCTCCGGCCGCTCCTCCGCCGTGAGATGGCTGTCGCGAGGCGGCCAACTCGCGGCGGCCGGTCACTTGCTTTGCATGTCAAAGGAGGCGGCTTGAAGATGAATGGTAGTTTGAGCACAGAAGAAGATAACTCCAAGCTGTTGAAAGAGTCGATGGGATTGGAAGACGACGGCCCGCCACGGTGGTTTTCGCCTTTGGAGAGTGGCCGGAGG...

XM_057924851.1
TCCCATCCATGGCGACTATTGTAGTAAATATTGGGCTTTGCCCCACCGGTCTCCGGCCGCTCCTCCGCCGTGAGATGGCTGTCGCGAGGCGGCCAACTCGCGGCGGCCGGTCACTTGCTTTGCATGTCAAAGGAGGCGGCTTGAAGATGAATGGTAGTTTGAGCACAGAAGAAGATAACTCCAAGCTGTTGAAAGAGTCGATGGGATTGGAAGACGACGGCCCGCCACGGTGGTTTTCGCCTTTGGAGAGTGGCCGGAGG...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130999335
ATGGCGACTATTGTAGTAAATATTGGGCTTTGCCCCACCGGTCTCCGGCCGCTCCTCCGCCGTGAGATGGCTGTCGCGAGGCGGCCAACTCGCGGCGGCCGGTCACTTGCTTTGCATGTCAAAGGAGGCGGCTTGAAGATGAATGGTAGTTTGAGCACAGAAGAAGATAACTCCAAGCTGTTGAAAGAGTCGATGGGATTGGAAGACGACGGCCCGCCACGGTGGTTTTCGCCTTTGGAGAGTGGCCGGAGGTCGCCGAG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057780832.1
MATIVVNIGLCPTGLRPLLRREMAVARRPTRGGRSLALHVKGGGLKMNGSLSTEEDNSKLLKESMGLEDDGPPRWFSPLESGRRSPRSPLLLFLPGIDGSGLGLTLHHRKLGEIFDIWCLHVPATDRTPLADLVMLVENTIRGEQDQSTKRPIYLVGESLGASLALVVAASNPDIDFLLILANPATNLSKSLVQSVLPLSNMIHNQPNDGLLDWLSSIPVETVMWKLKMIQEMQNYLDSHLHAVKAQTMILTSGRDMLLT...

XP_057780833.1
MATIVVNIGLCPTGLRPLLRREMAVARRPTRGGRSLALHVKGGGLKMNGSLSTEEDNSKLLKESMGLEDDGPPRWFSPLESGRRSPRSPLLLFLPGIDGSGLGLTLHHRKLGEIFDIWCLHVPATDRTPLADLVMLVENTIRGEQDQSTKRPIYLVGESLGASLALVVAASNPDIDFLLILANPATNLSKSLVQSVLPLSNMIHNQPNDGLLDWLSSIPETVMWKLKMIQEMQNYLDSHLHAVKAQTMILTSGRDMLLTS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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