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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004721`

染色体: Chr08 坐标: 56631340-56634500 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004721`
名称	SmilChr08G004721
描述	FRIGIDA-like protein 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56631340 - 56634500 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999341`
GeneID	`130999341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999341`
原始查询	`LOC130999341`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FRIGIDA-like protein 3
产物	FRIGIDA-like protein 3
Arabidopsis	`AT5G48385` (AT5G48385) FRIGIDA-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834893] identity=56.6; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0248300` - identity=54.7; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07899 (Frigida)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780846.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057780846.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780846.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780846.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780846.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56632237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:56632617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B78,C70,C85
`Chr8:56633530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:56633533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B139,B86,C87
`Chr8:56633582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C46
`Chr8:56633585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B64
`Chr8:56633585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr8:56633671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B78,C85
`Chr8:56633672`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C13,C22
`Chr8:56633959`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,C79
`Chr8:56634092`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B78,C85
`Chr8:56634093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B78,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780846.1

544 aa

272

544

Frigida

PF07899 Frigida 158-453 aa

XP_057780848.1

544 aa

272

544

Frigida

PF07899 Frigida 158-453 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780846.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	158	453	3.4e-108	362.1	Frigida-like protein
`XP_057780848.1`	Pfam	`PF07899`	Frigida	Family	158	453	3.4e-108	362.1	Frigida-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924863.1
CTGTCGGAATCAGACTGTCATAAATACAACCTCACTTCCCCACACATTCTCTTTCCTCTTTCCCAAACATTCTCTCTCTAGGGATTCGCCTCACCTCGCTTCCATGGTCTGAGCCTCCCGCTTCTCCGCCGCCTTCCGCCGCCGCTCAATTCTCCGCCGGCGCCGCCATTCGCGATCAGGATTTCTATGTCATGGAAGACAGCATAGCAACTCCAGCACTAATGGACTCGACAGCCTCTAAGATACAGCAGCTTCAAAAA...

XM_057924865.1
AATCAGACTGTCATAAATACAACCTCACTTCCCCACACATTCTCTTTCCTCTTTCCCAAACATTCTCTCTCTAGGGATTCGCCTCACCTCGCTTCCATGGTCTGAGCCTCCCGCTTCTCCGCCGCCTTCCGCCGCCGCTCAATTCTCCGCCGGCGCCGCCATTCGCGATCAGGTAAGCTCCGCTCTTCATTTCCAACCAGTTTTCGCCAGCTGATTCCGCCTATGCTTGCAGATCAAGCACCGTTTCTAGCATCTAGGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999341
ATGGAAGACAGCATAGCAACTCCAGCACTAATGGACTCGACAGCCTCTAAGATACAGCAGCTTCAAAAAGCATTTGCTGAACTTGAGAGTCATCGAGCCATTACTCTCAATTTGAAATGGAAGCAGCTTGAGGAGCATTTTCACGGGCTTCAGAAATCTCTAAAGAGACGTTTCACTGAGCTGGAAGAACAGGAAAAGGAATTTGATACCAAGATTGTCGAATCTAAAGAGATGTTGGAGAAGCGTAAAGCAGCTGTTGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780846.1
MEDSIATPALMDSTASKIQQLQKAFAELESHRAITLNLKWKQLEEHFHGLQKSLKRRFTELEEQEKEFDTKIVESKEMLEKRKAAVVAKEQTSLERLQEKRDAALSAIMTAMGKHEKPLSLGSGVLSRENKVEAPFLEDKASDVSVTKSIENIKALVKSYPGLVKLCQEINSEGLLKFISDNRKDLVTLREEIPVALRAARDPASLVLDSLKGFYGTDMPNSDAKKDSNLIGLRRTCIMLMECLSSLILGLDVDSVSGII...

XP_057780848.1
MEDSIATPALMDSTASKIQQLQKAFAELESHRAITLNLKWKQLEEHFHGLQKSLKRRFTELEEQEKEFDTKIVESKEMLEKRKAAVVAKEQTSLERLQEKRDAALSAIMTAMGKHEKPLSLGSGVLSRENKVEAPFLEDKASDVSVTKSIENIKALVKSYPGLVKLCQEINSEGLLKFISDNRKDLVTLREEIPVALRAARDPASLVLDSLKGFYGTDMPNSDAKKDSNLIGLRRTCIMLMECLSSLILGLDVDSVSGII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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