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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004667`

染色体: Chr08 坐标: 56170932-56176098 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004667`
名称	SmilChr08G004667
描述	aminoaldehyde dehydrogenase 2, peroxisomal
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56170932 - 56176098 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999345`
GeneID	`130999345`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999345`
原始查询	`LOC130999345`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aminoaldehyde dehydrogenase 2, peroxisomal
产物	aminoaldehyde dehydrogenase 2%2C peroxisomal
Arabidopsis	`AT1G74920` (ALDH10A8) aldehyde dehydrogenase 10A8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843831] identity=79.8; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0424500` (SK2(T)(SCL) - identity=76.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016620 (oxidoreductase activity, acting on the aldehyde or oxo group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	smil00260 (Glycine, serine and threonine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00670 (One carbon pool by folate - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00171 (Aldedh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999345

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780852.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057780852.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057780852.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780852.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56171125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B84,C45,C74,D3
`Chr8:56171147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,C13,C22,C30
`Chr8:56171160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:56172046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr8:56172057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:56172872`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B129
`Chr8:56172872`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B129
`Chr8:56173349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C5
`Chr8:56174829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:56174882`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr8:56174882`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr8:56175033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780852.1

503 aa

252

503

Aldedh

PF00171 Aldedh 16-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780852.1`	Pfam	`PF00171`	Aldedh	Family	16	485	3.1e-173	577.3	Aldehyde dehydrogenase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924869.1
TCTATTTTCTGCACATGGCATATATAATAAAATATGTTTCAATTAACTTTTTGTTGCTAATGTAAATAAATAAATATATACACACACCTGTAAAAAGATTACACAAAGTGCACGCACAACGAACCGGTGAAGTGATCATCCCAACAGCTCAGTCATGTCAATACCAATTCCTCACCGCCAACTCTTCATCGACGGCAAATGGAGACAGCCCGTGAACGGGAAACGCCTCCCCGTCACCAATCCCGCCACCGAAGAAATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999345
ATGTCAATACCAATTCCTCACCGCCAACTCTTCATCGACGGCAAATGGAGACAGCCCGTGAACGGGAAACGCCTCCCCGTCACCAATCCCGCCACCGAAGAAATTATCGGGGATATTCCGGCAGCTACGGCAGAGGATGTAAATATTGCTGTGGAAGCTGCCCGCAGAGCGCTTAGTCGGAATGGGGGAAAGGATTGGGCGTCTGCAACTGGCGCTCATCGTGCCAAGTATTTACGAGCGATTGCTGCAAAGGTTACGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780852.1
MSIPIPHRQLFIDGKWRQPVNGKRLPVTNPATEEIIGDIPAATAEDVNIAVEAARRALSRNGGKDWASATGAHRAKYLRAIAAKVTERKSELAKLEALDCGKPLDEAAWDIDDVAGCFEYYADMAEALDKKQKTPVSLPMETFKCHVIREPIGVVGLITPWNYPMLMATWKVAPALAAGCAAILKPSELASVTCLELADVCREVGLPPGVLNILTGLGPEAGAPLASHPHVDKIAFTGSTATGSKIMTAAAQLVKPVTLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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