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同源 qcov 为最佳单个 HSP 在查询序列上的坐标跨度／序列长度；置信度是规则分级，不是已验证的正交关系。

Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr08G004666

染色体: Chr08 坐标: 56165174-56168919 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr08G004666
名称SmilChr08G004666
描述uncharacterized SmilChr08G004666
染色体 / SeqIDChr08 / NC_080394.1
坐标与链方向56165174 - 56168919 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130999352
GeneID130999352
locus_tag-
NCBI NameLOC130999352
原始查询LOC130999352

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述ADP-glucose pyrophosphorylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843830]; symbol=AT1G74910; hit=AT1G74910; species=arabidopsis; confidence=high
产物ADP-glucose pyrophosphorylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843830]; symbol=AT1G74910; hit=AT1G74910; species=arabidopsis; confidence=high
ArabidopsisAT1G74910 (AT1G74910)
ADP-glucose pyrophosphorylase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843830]
identity=83.41; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
RiceOs03g0208900 (OsMPG2)
-
identity=83.86; qcov=1.0; evalue=0.0; confidence=high
GOGO:0005737 (cytoplasm); GO:0009058 (biosynthetic process)
KEGGsmil00051 (Fructose and mannose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
PfamPF00483 (NTP_transferase); PF25087 (GMPPB_C)
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130999352

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank定位位置中文五折投票比例Protein ID
1 Cytoplasm 细胞质 1.00000 XP_057780860.1
2 Cytosol 细胞质基质 0.40000 XP_057780860.1
3 Peroxisome 过氧化物酶体 0.20000 XP_057780860.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置 REF ALT 类型 影响 携带材料数 材料
Chr8:56165302 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B117,B57,C77
Chr8:56165326 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B120,B123
Chr8:56165360 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 C57
Chr8:56165374 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B105
Chr8:56165491 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 2 B120,B123
Chr8:56165926 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D10
Chr8:56166026 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B10
Chr8:56166227 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 4 A8,B40,C60,D6
Chr8:56166603 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 B5
Chr8:56166621 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 3 B127,B67,C74
Chr8:56166791 G A EMS_canonical_SNV CDS_variant 5 B130,B140,B9,C34,C5
Chr8:56166924 C T EMS_canonical_SNV CDS_variant 1 D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780860.1
415 aa
N
1
208
415
NTP_transferase
GMPPB_C
C
PF00483 NTP_transferase 10-205 aa PF25087 GMPPB_C 297-414 aa
XP_057780861.1
415 aa
N
1
208
415
NTP_transferase
GMPPB_C
C
PF00483 NTP_transferase 10-205 aa PF25087 GMPPB_C 297-414 aa
Protein ID 来源 结构域编号 结构域名称 类型 起始 aa 终止 aa E-value Score 说明
XP_057780860.1 Pfam PF00483 NTP_transferase Family 10 205 2.5e-31 109.8 Nucleotidyl transferase
XP_057780860.1 Pfam PF25087 GMPPB_C Repeat 297 414 1.2e-37 128.8 GMPPB C-terminal domain
XP_057780861.1 Pfam PF00483 NTP_transferase Family 10 205 2.5e-31 109.8 Nucleotidyl transferase
XP_057780861.1 Pfam PF25087 GMPPB_C Repeat 297 414 1.2e-37 128.8 GMPPB C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA
XM_057924877.1
CTCTTGTTTTAAGCTGGCAATGCATTATGCCCCACATGCAAGCAAAGCGCCAATCTCTCATGAAATTTGAGGTGGAAACTTGCCACCCTACCCCACCCCACCCCACCCCCAACCCCAGTTGAAAATTACCGGACTGACAGATTAAATCTTCAACTGATTTAGTTTTTTTATTTGTTCACTCAATCTTGAAAGCACTCTTTCATTGTTCAAATTTTCACTTATTTTCAGCTCACATGATTGGTTCAAGATTTCTTGTCCTG...
XM_057924878.1
AATCTCTCATGAAATTTGAGCTCTTACAAAGGTTGTTGAAGTGAGTTTTAGAGATCTAGTTTTTGGGGGGGCTTTTTTATTTTTTCTTTTTCTGGTGTTGGGAAAATGGGGAGTTCAGAAGAGAGAGTTGTGGCTGTGATCATGGTGGGTGGCCCCACTAAAGGGACCAGATTTAGGCCATTGTCACTTAATGTTCCAAAACCCCTCTTTCCATTGGCTGGGCAGCCAATGGTTAATCATCCTATATCTGCTTGCAAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780860.1_45944
ATGGGGAGTTCAGAAGAGAGAGTTGTGGCTGTGATCATGGTGGGTGGCCCCACTAAAGGGACCAGATTTAGGCCATTGTCACTTAATGTTCCAAAACCCCTCTTTCCATTGGCTGGGCAGCCAATGGTTAATCATCCTATATCTGCTTGCAAAAGGATACCAAATCTAGCACAGATCTACCTCATTGGTTTCTACGAGGAGCGTGAATTTGCACTGTTTGTCTCTTCCATATCCAATGAGCTCAGAGTTCCTGTCAGGTA...
lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780861.1_45945
ATGGGGAGTTCAGAAGAGAGAGTTGTGGCTGTGATCATGGTGGGTGGCCCCACTAAAGGGACCAGATTTAGGCCATTGTCACTTAATGTTCCAAAACCCCTCTTTCCATTGGCTGGGCAGCCAATGGTTAATCATCCTATATCTGCTTGCAAAAGGATACCAAATCTAGCACAGATCTACCTCATTGGTTTCTACGAGGAGCGTGAATTTGCACTGTTTGTCTCTTCCATATCCAATGAGCTCAGAGTTCCTGTCAGGTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA
XP_057780860.1
MGSSEERVVAVIMVGGPTKGTRFRPLSLNVPKPLFPLAGQPMVNHPISACKRIPNLAQIYLIGFYEEREFALFVSSISNELRVPVRYLKEDKPHGSAGGLYNFRDQIMEESPSHIFLLNCDVCCSFPLAQMLEAHTSYGGMGTILVIKVSPESASQFGELVADPVTNELLHYTEKPETFVSDRINCGVYIFTPDIFTAIQGVSSQRKDRATLRRVSSFEALQPANRSLPSDFVRLDQDILSPLAGKRQFYVYETTDYWEQ...
XP_057780861.1
MGSSEERVVAVIMVGGPTKGTRFRPLSLNVPKPLFPLAGQPMVNHPISACKRIPNLAQIYLIGFYEEREFALFVSSISNELRVPVRYLKEDKPHGSAGGLYNFRDQIMEESPSHIFLLNCDVCCSFPLAQMLEAHTSYGGMGTILVIKVSPESASQFGELVADPVTNELLHYTEKPETFVSDRINCGVYIFTPDIFTAIQGVSSQRKDRATLRRVSSFEALQPANRSLPSDFVRLDQDILSPLAGKRQFYVYETTDYWEQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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