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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004642`

染色体: Chr08 坐标: 55933836-55935494 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004642`
名称	SmilChr08G004642
描述	uncharacterized SmilChr08G004642
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55933836 - 55935494 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999356`
GeneID	`130999356`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999356`
原始查询	`LOC130999356`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619]; symbol=AT5G64950; hit=AT5G64950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G64950` (AT5G64950) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836619] identity=28.1; qcov=0.911; evalue=4e-37; confidence=low
Rice	`Os06g0225100` - identity=28.2; qcov=0.869; evalue=1.3e-29; confidence=low
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009658 (chloroplast organization)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999356

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057780864.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780864.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780864.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780864.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780864.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55934196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C22,C76
`Chr8:55934307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C50
`Chr8:55934548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C14
`Chr8:55934580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C43,C73
`Chr8:55934589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:55934604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr8:55934653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B87,C50
`Chr8:55934681`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr8:55934683`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	69	A15,A20,A22,A24,A4,A7,B102,B109,B111,B112,B114,B115,B119,B123,B124,B128,B134,B135,B14,B16,B17,B20,B3,B45,B47,B49,B52,B54,B56,B57,B58,B78,B79,B82,B90,B92,B96,B97,B98,C1,C15,C20,C21,C25,C29,C34,C39,C47,C49,C5,C52,C56,C57,C6,C61,C64,C66,C67,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C86,D2,D4,D9
`Chr8:55934812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C82,C85
`Chr8:55934849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:55935153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780864.1

383 aa

192

383

mTERF

PF02536 mTERF 48-203 aa PF02536 mTERF 250-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780864.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	48	203	6e-33	114.8	mTERF
`XP_057780864.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	250	357	6e-33	114.8	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924881.1
GTAAGTGAGAGAGGTGAAAGTGATATTGAAACTAAGCTCTCCCTTCCCTGCCATGGCGACGCCGCTGCTTCAGAAACCCTCAATCCAGAAGCTTTGAGTCCATCCATTTTTCAGGCAAGTCGTTCATCATTTCCCAACACATCTTCTATTTCTATCGAAACATGATTGCAATTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCATCTCTTCCCGTCAATCCATTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999356
ATGATTGCAATTGCACGCAGGAATCTCTCCTGTTTATTTGTAAACCCTAATTCATTTCTCTGCAACTCCAATGCTCATCTCTTCCCGTCAATCCATTTCTTCTCCACTTGGAGGGTGAAAAACCCAATCCCTAGCCCTGAAATCTACGATCTATTGCTCAACAAACACCAATTTCTTCCTGAATTAGCTTCAATAGCTTCAACTGGTTTACCTAAAGCTAGTAGCCCCATAGGAGCTGATTCAGTAGTGTCATTCCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780864.1
MIAIARRNLSCLFVNPNSFLCNSNAHLFPSIHFFSTWRVKNPIPSPEIYDLLLNKHQFLPELASIASTGLPKASSPIGADSVVSFLKENSFTATQLQKVVTYDSRILGFTIESINFKLKVFQSLGLSPKEIAKIISEHATILHLSYENSIIPKLSMLKCLLGSDHDVARLLKRCSWFLSAVLEKTLMPNMEILKSYSIPMVHILHFLYLRPRCFVVKPDIMQKSVVRAIEFGVPWTSGVFIQAVNLFTHTSEGMWEVKVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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