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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004633`

染色体: Chr08 坐标: 55845796-55846692 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004633`
名称	SmilChr08G004633
描述	uncharacterized protein At2g29880-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55845796 - 55846692 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999369`
GeneID	`130999369`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999369`
原始查询	`LOC130999369`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784]; symbol=AT5G27260; hit=AT5G27260; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=34; qcov=1.01; evalue=8.32e-28; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24769 (At2g29880_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999369

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780884.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780884.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780884.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780884.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780884.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55845945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C65
`Chr8:55845950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	70	A10,A18,A21,A3,A5,A8,B1,B10,B105,B106,B113,B115,B118,B121,B122,B125,B13,B131,B136,B18,B20,B28,B29,B33,B34,B38,B39,B40,B45,B47,B5,B50,B56,B58,B59,B62,B65,B67,B71,B75,B85,B88,B9,B97,B98,C13,C18,C22,C29,C3,C34,C37,C4,C44,C45,C46,C50,C54,C59,C60,C62,C65,C68,C7,C73,C74,C78,C84,D1,D5
`Chr8:55846053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C9
`Chr8:55846084`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A7,B109,B130,B2,B22,C14,C17,C26,C44,C57,C76
`Chr8:55846090`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C65
`Chr8:55846109`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B117
`Chr8:55846109`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B117
`Chr8:55846125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B81
`Chr8:55846145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr8:55846209`	`AC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A3
`Chr8:55846354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C3
`Chr8:55846390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780884.1

235 aa

118

235

At2g29880_C

PF24769 At2g29880_C 187-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780884.1`	Pfam	`PF24769`	At2g29880_C	Domain	187	231	5.8e-17	62.5	At2g29880 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924901.1
ACAAACTTAGGTGCAATAAAAATTATAATCACTACCAAAGTCGTATCAAATGGTTTAAGAGCCGTTGGACTGCGTATTCAAACCTCATGAAGTCTAACTCTGGTTTTGGTTATGACAACGACACCAAAAAATTCACGGCCCCAGATGAAGTATGGGATGCGTATATAGAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTACGCACTGGGAGTTTTTCGGACTATGATGACTTGAGATTTGCTGTTGGAAACGGTGTGGCTGTAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999369
ATGAAGTCTAACTCTGGTTTTGGTTATGACAACGACACCAAAAAATTCACGGCCCCAGATGAAGTATGGGATGCGTATATAGAGGCTCACCCAAAAGATGCATACTTACGCACTGGGAGTTTTTCGGACTATGATGACTTGAGATTTGCTGTTGGAAACGGTGTGGCTGTAGGAAGAAACGCAATTGGAGTTGGCAGTGCTACTGATGCTAGGACAATAGGAGTTGATGAAAGTAGAGGTCCAACCATAGAGGAGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780884.1
MKSNSGFGYDNDTKKFTAPDEVWDAYIEAHPKDAYLRTGSFSDYDDLRFAVGNGVAVGRNAIGVGSATDARTIGVDESRGPTIEELNYDTATEAFVVLGEGDPPLSGSKSPLEPTEVPVESTQRRAPAKRSRGQFETNSGHTENSPHQELLVQIKKVTSTMDRVESLFVKRDTMMEKRENEKSFTTWDAIEEIPDLSEEDRYTAFDLLVTKSQKDGFMKMTVPQRKRWIELKTRK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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