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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004677`

染色体: Chr08 坐标: 56265562-56266599 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004677`
名称	SmilChr08G004677
描述	transcription factor bHLH52-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56265562 - 56266599 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999371`
GeneID	`130999371`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999371`
原始查询	`LOC130999371`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH52-like
产物	transcription factor bHLH52-like
Arabidopsis	`AT1G30670` (AT1G30670) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839947] identity=45.2; qcov=0.543; evalue=3.34e-20; confidence=low
Rice	`Os01g0831000` (LAX1) - identity=45.2; qcov=0.315; evalue=4.48e-12; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999371

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780886.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780886.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780886.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780886.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780886.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56265716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,B94
`Chr8:56265947`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C23
`Chr8:56265988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr8:56266047`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B44
`Chr8:56266048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B57
`Chr8:56266094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B6
`Chr8:56266388`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780886.1

232 aa

116

232

HLH

PF00010 HLH 124-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780886.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	124	168	2.1e-07	31.4	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924903.1
TGCTCACTTCTGCTTCGTACTAGGTTAACCTCTGTCATCATCATTGATTTCACAGGTAATCCCTTCTTCATCAATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGCTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTTCTGCAACTCTCTTCTCTGCGACGATCTCACTTATCATGCTAATGGACTTCCCTTGGAATTGGATAATCTCACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999371
ATGGCGTTGAGCTACTACTCCAACTGGACCTCTTTTCAGCAGCCAGACTACTCCGGCGATGATCCAGAGCTCCAATCTCTGCTGAACCCGGACGACTATTTCGCCGACTCCTTCTGCAACTCTCTTCTCTGCGACGATCTCACTTATCATGCTAATGGACTTCCCTTGGAATTGGATAATCTCACAACTGCAACCCAACCCCCACCCTTTCTTTTGCCGCACCAACAACCCTTGTTCCACTTCCCCAAACGCCACAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780886.1
MALSYYSNWTSFQQPDYSGDDPELQSLLNPDDYFADSFCNSLLCDDLTYHANGLPLELDNLTTATQPPPFLLPHQQPLFHFPKRHKLYDYSLPKFVLRPPLPQFPAAGFSCESAKNETSLSAQSIAARQRRRKITVKTQELGKLVPGGQRMNTAEMLQSAYNYIKFLQAQVALLGSHHQEVPFEGEEELQNLLESPLIQEKLYSTQHCLLPNKLAEQVPLLKSNPHLLEKDH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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