当前解析结果
SmilChr08G004687| 统一新 Gene ID | SmilChr08G004687 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G004687 |
| 描述 | replication factor A protein 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 56330601 - 56331242 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999380 |
|---|---|
| GeneID | 130999380 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999380 |
| 原始查询 | LOC130999380 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | replication factor A protein 1-like |
| 产物 | replication factor A protein 1-like |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02721 (DUF223) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999380 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057780894.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057780894.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057780894.1 |
| 4 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.20000 | XP_057780894.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057780894.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057780894.1PF02721
DUF223 3-103 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057780894.1 |
Pfam | PF02721 |
DUF223 | Domain | 3 | 103 | 4.2e-07 | 30.9 | Domain of unknown function DUF223 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。