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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004673`

染色体: Chr08 坐标: 56223219-56225655 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004673`
名称	SmilChr08G004673
描述	rhomboid-like protein 19
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56223219 - 56225655 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999385`
GeneID	`130999385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999385`
原始查询	`LOC130999385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhomboid-like protein 19
产物	rhomboid-like protein 19
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057780900.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057780901.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.40000	`XP_057780900.1`
4	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057780900.1`
5	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057780900.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56223440`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B120,B139,B62,B98,C18,C22,C44,C62
`Chr8:56223443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C85,D3
`Chr8:56223444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:56223465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B80,C85,D8
`Chr8:56223465`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B80,C85,D8
`Chr8:56223472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C29,C72,D2
`Chr8:56223474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A9,B51,C15,C52,C8
`Chr8:56223474`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B51,C15,C52,C8
`Chr8:56223799`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:56223931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C19
`Chr8:56224546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C52,C8
`Chr8:56225249`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	22	A22,B1,B100,B119,B123,B128,B13,B29,B30,B44,B73,B78,B93,B95,C10,C32,C39,C51,C68,C73,C75,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093485.1
TAAACTCTCGCTCACTCTCGCACGCAGCACGCTAATCAGAACCGCCGCACCGTCCAGTCGCTCACTCTCTTGCGTTACGGCTGCCGGTCACCGTCTCTCACGGCGTGGCTACCAGTCAATGTTGCTCACAGCGCGGCGGCTCTTCCTCTGTTTTAATCACCATTTCTCTCTCAAGCCGGTTACTCTCTTCCATGCCCTAACTTCCCTGCCCATTCTCTCGGCGCCACCATTGAAGCTCGCCTCCGCCAAACCCTTGCGCG...

XR_009093484.1
TAAACTCTCGCTCACTCTCGCACGCAGCACGCTAATCAGAACCGCCGCACCGTCCAGTCGCTCACTCTCTTGCGTTACGGCTGCCGGTCACCGTCTCTCACGGCGTGGCTACCAGTCAATGTTGCTCACAGCGCGGCGGCTCTTCCTCTGTTTTAATCACCATTTCTCTCTCAAGCCGGTTACTCTCTTCCATGCCCTAACTTCCCTGCCCATTCTCTCGGCGCCACCATTGAAGCTCGCCTCCGCCAAACCCTTGCGCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999385
ATGTCTCCGCCTGCATCGTTTCTATTGATGTCGCCGCCACCACCATGCCCGGCCGTCTCCGTTGTCGCTCTTATAAGGACAATTCCTTTTGCTTGGAATCTCATTACAGCTGAATATGTTGAACAATCTACGGGATTAATGTTAATGGAAAGTGCTCAATTGGAGAGATATATAAACTGCGGTCAGAGTTGGCATATGATGAGTATTAAGGATATGGTGAAGAAAAGAAGACAACATTGGACATATTGGTTCATGCATCA...

LOC130999385
ATGAATATGAGCGCATTATTCACAAAGTTGTGCAAGGGGCTGGCAGTGGTATTAATAGGCGGCCACTTTGCTGTGCAGATTTCCTCCGCTGTTTCTTATCTAGTTCTCATCCCTGCCAAGACAATTCCTTTTGCTTGGAATCTCATTACAGCTGAATATGTTGAACAATCTACGGGATTAATGTTAATGGAAAGTGCTCAATTGGAGAGATATATAAACTGCGGTCAGAGTTGGCATATGATGAGTATTAAGGATATGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057780900.1
MNMSALFTKLCKGLAVVLIGGHFAVQISSAVSYLVLIPAKTIPFAWNLITAEYVEQSTGLMLMESAQLERYINCGQSWHMMSIKDMVKKRRQHWTYWFMHHILKERRSNKY

XP_057780901.1
MSPPASFLLMSPPPPCPAVSVVALIRTIPFAWNLITAEYVEQSTGLMLMESAQLERYINCGQSWHMMSIKDMVKKRRQHWTYWFMHHILKERRSNKY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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