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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004098`

染色体: Chr01 坐标: 59440008-59447385 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004098`
名称	SmilChr01G004098
描述	sulfate transporter 3.1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59440008 - 59447385 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999430`
GeneID	`130999430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999430`
原始查询	`LOC130999430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sulfate transporter 3.1-like
产物	sulfate transporter 3.1-like
Arabidopsis	`AT3G51895` (SULTR3;1) sulfate transporter 3;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824353] identity=73.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0161200` (OsSultr3) - identity=70.1; qcov=0.94; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008271 (secondary active sulfate transmembrane transporter activity); GO:0008272 (GO:0008272); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00916 (Sulfate_transp); PF01740 (STAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780939.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057780939.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057780939.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780939.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780939.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59440307`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B134,B59,B65,B8,B89,C15,C55,C57,C64,C66
`Chr1:59440354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:59443361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:59445871`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B30,B54,B90,C26,C82
`Chr1:59445871`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B30,B54,B90,C26,C82
`Chr1:59446960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,C26,C27,C54,C58
`Chr1:59447169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B31,B47,C83,D1
`Chr1:59447169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B47,C83,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780939.1

663 aa

332

663

Sulfate_transp

STAS

PF00916 Sulfate_transp 87-467 aa PF01740 STAS 521-637 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780939.1`	Pfam	`PF00916`	Sulfate_transp	Family	87	467	3e-142	474.6	Sulfate permease family
`XP_057780939.1`	Pfam	`PF01740`	STAS	Domain	521	637	1.2e-28	99.6	STAS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924956.1
AGAAAAAAAAAAGCTAAGATTCCAAATTAATACCAACAATCTACATGTGTGCTTGTGTTTATTTTTGGCCCCACAAACGCACTCAAACATGCACCTATAAAACCCCCCCCCTCATACTTTCTTCTTCTTATCACAAAATCCCTAAAACAAACAATATTACATGCTCAAATAGCCTTACTCACATATATCTATCAAGAAATAAAACCATCATACTACAAATTAAGCCTTCTCTCGACCAAACTAAGCTTATTACAAAAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999430
ATGGGCAACGCCGATGATACGTACCCGTCATCCAATAAGTACGGCTCCGGCTCCGGCTCCGGCTGCGGCGGCCAGCGTGTGGCCATACCCCCACCGCAGCCGTTCGTGACGTCGCTCAAGAACACGTTAAAGGAGACGCTGTTCCCGGACGACCCTCTCCGGCAGTTCAAGAACCAGCCGCGGCGGAGGAAGTTGGTCCTCGGCCTGCAATACATTTTCCCGATCCTCGAGTGGGGCCCGCGTTACAGGCTGGACTCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780939.1
MGNADDTYPSSNKYGSGSGSGCGGQRVAIPPPQPFVTSLKNTLKETLFPDDPLRQFKNQPRRRKLVLGLQYIFPILEWGPRYRLDSFKSDLIAGITIASLAIPQGISYAKLANLPPILGLYSSFVPPLVYAVMGSSRDLAVGTVAVGSLLMGSMLGSVVNSKDDPKLYLHLAFTATFAAGLFEAALGIFRLGFIVDFLSHATIVGFMSGAATVVCLQQLKGILGLDHFTHATDIISVMRSVFSQTHKWRWESAVLGCVFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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