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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004761`

染色体: Chr08 坐标: 56975211-56977537 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004761`
名称	SmilChr08G004761
描述	uncharacterized SmilChr08G004761
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	56975211 - 56977537 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999432`
GeneID	`130999432`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999432`
原始查询	`LOC130999432`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0175900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0175900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G19270` (AT2G19270) mitotic checkpoint protein PRCC-carboxy-term protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816444] identity=44.2; qcov=0.736; evalue=3.07e-58; confidence=medium
Rice	`Os02g0175900` - identity=36.6; qcov=1.09; evalue=8.05e-61; confidence=medium
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF10253 (PRCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999432

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780937.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780937.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780937.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057780937.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057780937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:56975606`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:56975651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56975688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C46
`Chr8:56975926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B88,C32,C68
`Chr8:56975946`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:56976349`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A11,A15,A18,A23,A4,A5,B1,B101,B107,B109,B11,B120,B121,B122,B127,B133,B134,B137,B140,B15,B16,B18,B19,B22,B33,B36,B41,B47,B50,B52,B53,B63,B65,B67,B70,B76,B77,B79,B8,B84,B87,B88,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C20,C23,C25,C26,C29,C34,C37,C40,C41,C46,C48,C54,C56,C57,C61,C68,C69,C7,C73,C74,C75,C77,C8,C82,C83,C87,D10,D11,D6,D7
`Chr8:56976353`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	84	A11,A15,A18,A23,A4,A5,B1,B101,B107,B109,B11,B120,B121,B122,B127,B133,B134,B137,B140,B15,B16,B18,B19,B22,B33,B36,B41,B47,B50,B52,B53,B63,B65,B67,B70,B76,B77,B79,B8,B84,B87,B88,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C20,C23,C25,C26,C29,C34,C37,C40,C41,C46,C48,C54,C56,C57,C61,C68,C69,C7,C73,C74,C75,C77,C8,C82,C83,C87,D10,D11,D6,D7
`Chr8:56977286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:56977304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780937.1

443 aa

222

443

PRCC

PF10253 PRCC 103-443 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780937.1`	Pfam	`PF10253`	PRCC	Family	103	443	7.1e-12	47.3	Mitotic checkpoint regulator, MAD2B-interacting

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924954.1
TTTTATTTTTTTTGTTGAAAGGTGATATGGCCTTAGATTGAATGGCTATTTCCCCCTAATCGTGATCAAATTCCGTACAAAAATCCCTTTTGAACCCTAATTCAGCAATCTTCATCTCCTCTGCTATTCGGTAATTTTTCCGATGGATTTGCTCGGAAATTACGCCTCCTCCGACGAAGAGGAGCACGAAGAACAGCCGCCTCCGCCGTCGCAGCTAAAACAGCCGGCGAAGCTAGCTAAATATGTGGAAGAAAACGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999432
ATGGATTTGCTCGGAAATTACGCCTCCTCCGACGAAGAGGAGCACGAAGAACAGCCGCCTCCGCCGTCGCAGCTAAAACAGCCGGCGAAGCTAGCTAAATATGTGGAAGAAAACGACGACGATTTTCTACCCAAATCCGCCCCGAAACGCGGCGGAATCTTCAATTCTCTCCCGCCGCCCAAATCGTCTTTCTTCAATTCACTCCCACCGCCCAAATCCCAATCCTCCCCTAACCCTAAGCCCCAATCGGGAGCAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780937.1
MDLLGNYASSDEEEHEEQPPPPSQLKQPAKLAKYVEENDDDFLPKSAPKRGGIFNSLPPPKSSFFNSLPPPKSQSSPNPKPQSGAEDRVDAEEITENLKPKSSLFSSLPRPKSSSAAAAASSAAKKVVQFKPPMITNPYSRSLDEDEDDDDDKGEEERKRKRSREKISTTSATSFLSSIPAPKHSATLGAMPSASGMGRRSMLETSSPASNVSTGSDADAYPSVGYSNNQSDDANYANYSDNGAASNPDSTNYGVYDHST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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