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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004798`

染色体: Chr08 坐标: 57302858-57306478 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004798`
名称	SmilChr08G004798
描述	probable disease resistance protein At1g58602
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57302858 - 57306478 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999465`
GeneID	`130999465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999465`
原始查询	`LOC130999465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable disease resistance protein At1g58602
产物	probable disease resistance protein At1g58602
Arabidopsis	`AT1G58390` (AT1G58390) Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842208] identity=34.04; qcov=0.995; evalue=3.04e-137; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=27.43; qcov=0.995; evalue=8.18e-75; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF13191 (AAA_16); PF18052 (Rx_N); PF23559 (WHD_DRP); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999465

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057780975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57303341`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B27,B29,B51,B58,B87,C31
`Chr8:57303377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:57303417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B96,C26,D3
`Chr8:57303423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B108
`Chr8:57303428`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,C64,D3
`Chr8:57303439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A5,C64
`Chr8:57303442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A18,A2,A3,B103,B106,B112,B117,B129,B132,B19,B29,B61,B62,B84,B86,C39,C40,C72,C73,C74,C76
`Chr8:57303469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C82
`Chr8:57303488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B12,C31,C56
`Chr8:57303493`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B108,B12,C56
`Chr8:57303493`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B108,B12,C56
`Chr8:57303543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B12,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780975.1

928 aa

464

928

Rx_N

AAA_16

NB-ARC

WHD_DRP

LRR_14

PF18052 Rx_N 5-87 aa PF13191 AAA_16 166-283 aa PF00931 NB-ARC 170-343 aa PF23559 WHD_DRP 426-505 aa PF23598 LRR_14 562-895 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780975.1`	Pfam	`PF18052`	Rx_N	Domain	5	87	9.9e-19	68.0	Rx N-terminal domain
`XP_057780975.1`	Pfam	`PF13191`	AAA_16	Domain	166	283	9.9e-09	36.6	AAA ATPase domain
`XP_057780975.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	170	343	3.2e-37	128.5	NB-ARC domain
`XP_057780975.1`	Pfam	`PF23559`	WHD_DRP	Domain	426	505	1e-11	45.4	Disease resistance protein Winged helix domain
`XP_057780975.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	562	895	6.6e-25	88.3	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057924992.1
ACTATTGGCGATCGAAGGCAGCAGCTGTACAATTACGACCACAACTTCCTTATCTTTTCTAATTAACTTCCCTCTCACCACTACCAAATCAAGAGTGTTCAACCAATCAATTTGATATATCGGAGCTTCCCCAAATTAGCAAATCAAGAGTGTTCCACCAATCAATTAGACCAAAGAAATCTGAGCTTCCCCCAAATTATTGCAATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057780975.1_46100
ATGGCAGAAGCAGTGGTGTCGACTGCTCTAGAAACCTTGCGCGATTTGTTGGTGGAAGAAGCAAGGTTTTTATATGGTGTGGGTGACCAAGTGAGGGAGTTCGAGATCCAGCTCAAAGAGATGAAATGTTTCCTTGAAGATGCTGACAGAAGACGACACGAAAGCAAAACCATTTTGAATTGGATCTCAGAGATCAAAGATCTTGTGTACAGAGCAGAAGCAGCCATTGAAAGACACACAGCTTATCAAGTGTGTTCAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780975.1
MAEAVVSTALETLRDLLVEEARFLYGVGDQVREFEIQLKEMKCFLEDADRRRHESKTILNWISEIKDLVYRAEAAIERHTAYQVCSRRRRGLRQLICRYSCILEEGYSLHQLGSEISQIKSDLGRVTEAMRAYGIKNIIDRGESSAAGNNNRARKTFPEFVIGDCFVGMKDELKQLLHLLLEDEKHRVISVWGMGGSGKTTIAKKLYNEIKTSFDICAWVCISQQCPSFQSVWKDVLKQLEHQNTKDGPKIREDVTSLNE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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