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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004815`

染色体: Chr08 坐标: 57443526-57444877 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004815`
名称	SmilChr08G004815
描述	serine/threonine-protein kinase OXI1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57443526 - 57444877 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999477`
GeneID	`130999477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999477`
原始查询	`LOC130999477`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase OXI1-like
产物	serine/threonine-protein kinase OXI1-like
Arabidopsis	`AT4G13000` (AT4G13000) AGC (cAMP-dependent, cGMP-dependent and protein kinase C) kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826913] identity=52.9; qcov=1.08; evalue=2.76e-127; confidence=high
Rice	`Os04g0304200` (PHOT2) - identity=41.5; qcov=0.912; evalue=3e-66; confidence=medium
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057780990.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057780990.1`
3	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057780990.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057780990.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057780990.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57443768`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B11,B53,B93
`Chr8:57443858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B11,B53,B93
`Chr8:57443864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:57443885`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	36	A13,A23,B120,B125,B126,B128,B130,B134,B136,B19,B23,B25,B3,B30,B31,B47,B49,B6,B66,B72,B75,B78,B89,B9,B99,C17,C2,C21,C24,C26,C27,C51,C56,C75,C8,C87
`Chr8:57444079`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B17,B65,B74,C69
`Chr8:57444079`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B17,B65,B74,C69
`Chr8:57444102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B17,B65,C69
`Chr8:57444179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B40,C60,C62
`Chr8:57444206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B82
`Chr8:57444227`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:57444230`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B104,B11,B53,B93
`Chr8:57444378`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C21,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057780990.1

330 aa

165

330

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 16-280 aa PF00069 Pkinase 16-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057780990.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	16	280	1.7e-22	80.7	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057780990.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	16	286	1e-51	176.6	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925007.1
GCTAGGTAAGTGTAACGCATTACGCAGTGTATCTTATCCATGCATATATACTTTGACAAACACTACTCACTTTATTAATATCATATTATCAAATCTCCTTCTCTCTCCCCCTCTCTCTCTCACTCAAATCCAGCCATCTCCGCCATGCACGGCGGCGATGCTACGCCTTCTCTACAGCTGTCTAGCCTCCAGGTCATATCAGCCATTGGCCGCGGCGCCAACGGCGTGGTTTTCCTCGTGCGGACGGACGAGGGGGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999477
ATGCACGGCGGCGATGCTACGCCTTCTCTACAGCTGTCTAGCCTCCAGGTCATATCAGCCATTGGCCGCGGCGCCAACGGCGTGGTTTTCCTCGTGCGGACGGACGAGGGGGAGCTGCTCGCGCTCAAAGCGATCTTAGAATCTTCAAATCGGAAAACGAAGGTCGAAGGCGGCGAGGATTGCAGGAGAACTCGGCTAGAGAGAGAATTTCTGAGCTCCTTCGATCATCCGCTGCTGCCGAAGCTTCATGGAGTGGTGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057780990.1
MHGGDATPSLQLSSLQVISAIGRGANGVVFLVRTDEGELLALKAILESSNRKTKVEGGEDCRRTRLEREFLSSFDHPLLPKLHGVVITDKIVGYAIDFCPGRDLNSLRKKQTEKIFSDDIIRFYAAELVLALEYLHGLRIVYRDLKPENVMIQSNGHLMLVDFDLSTKLTARSRPETFPLGGESVERERSNSFVGTEDYIAPEIVLGSGHSFAVDWWCFGVVLYEMRYGTTPFRGPDRRKTYRRIVTEEPELTGELTPLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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