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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004819`

染色体: Chr08 坐标: 57474275-57477290 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004819`
名称	SmilChr08G004819
描述	U-box domain-containing protein 9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57474275 - 57477290 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999481`
GeneID	`130999481`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999481`
原始查询	`LOC130999481`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U-box domain-containing protein 9
产物	U-box domain-containing protein 9
Arabidopsis	`AT3G07360` (PUB9) plant U-box 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819924] identity=56.8; qcov=1.01; evalue=1.86e-178; confidence=high
Rice	`Os02g0488600` (OsPUB8) - identity=50.5; qcov=0.851; evalue=7.32e-143; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00514 (Arm); PF04564 (U-box); PF25598 (ARM_PUB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999481

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781001.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057781001.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057781001.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781001.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57474690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:57474868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr8:57474927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B98,C38
`Chr8:57474950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:57474978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57475074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C38
`Chr8:57475083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B21,B47,B55
`Chr8:57475170`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57475215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr8:57475278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A25,B10,C78,D11
`Chr8:57475303`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B33
`Chr8:57475378`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781001.1

463 aa

232

463

U-box

ARM_PUB

Arm

PF04564 U-box 78-148 aa PF25598 ARM_PUB 175-453 aa PF00514 Arm 293-330 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781001.1`	Pfam	`PF04564`	U-box	Domain	78	148	2.9e-22	79.3	U-box domain
`XP_057781001.1`	Pfam	`PF25598`	ARM_PUB	Repeat	175	453	9.4e-14	52.2	Plant U-box protein ARM repeat region
`XP_057781001.1`	Pfam	`PF00514`	Arm	Repeat	293	330	2.5e-14	53.5	Armadillo/beta-catenin-like repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925018.1
CTTAGGTGTGTATTTAAGATGAGATGAGAAGCGGATGTTTCTTGTCCTCTCCGCGTAGAGTGCCAGCTGTGGCGCCACGGCTGCCCGCTTGATTGCATCACCCCCACCGAGACTCCCATTTCGTATTCCATACCTCACTCACTCACCGTGTGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGACCTTCAAATTCTGAGCCGTAAAGCGAAAGCCACGCGACGAAGAATGGGGGAAAGGAGATAACAAGGAATCGCAAAAAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999481
ATGGCGAAGAGCGGCGCGGCAGAAGGGGACCAGGCGGCGGCGGCGAGAGCCATGGAGCTTAAGAGAGAACTGAAGAGGCTGGTGAAGTCGATCGCGGAAGATGACGGCGACGATGTTATAAATCTCGAGGCGATTGACAGAGCGCAGAAAACGCTGCGCGCGATGAGGGAATTGAGGCTGAAGAGAAGCGGCGGTTTGACGGCGTGCGACGGCGAGACGGCGGCGGGGGCGGTGCCGGAGGAGTTTAAGTGCCCGCTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781001.1
MAKSGAAEGDQAAAARAMELKRELKRLVKSIAEDDGDDVINLEAIDRAQKTLRAMRELRLKRSGGLTACDGETAAGAVPEEFKCPLSMELMRDPVIIASGQTFDRPFIQKWLKSGNRTCPRTQQVLSHTILTPNHLIRGMIVQWCKMHGIKLPESVDYTNEEPLAEVDRARFLSLLKKMSSASRLDQREAAKEFRLLTKRTPSFRALFGESLDAIPQLLSPLSQTKHDGEPHPDLQEDLITTLLNLSIHDNNKKLVAETP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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