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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004872`

染色体: Chr08 坐标: 57848588-57850514 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004872`
名称	SmilChr08G004872
描述	probable polyamine transporter At3g13620
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57848588 - 57850514 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999530`
GeneID	`130999530`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999530`
原始查询	`LOC130999530`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable polyamine transporter At3g13620
产物	probable polyamine transporter At3g13620
Arabidopsis	`AT3G13620` (PUT4) Amino acid permease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820565] identity=68.8; qcov=0.92; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0700500` (OsPUT1) - identity=47.3; qcov=0.934; evalue=5.75e-145; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999530

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057781064.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057781064.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057781064.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781064.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781064.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57848860`	`AT`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr8:57848864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:57848866`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B94
`Chr8:57848866`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B94
`Chr8:57848877`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:57848955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B75,C71
`Chr8:57848957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,B94
`Chr8:57849150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B19,B42,B43,B52,B58,C18,C44,C46,C48,C55,C58,C71
`Chr8:57849200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C37
`Chr8:57849226`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B119,B65,C69,D1
`Chr8:57849226`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B119,B65,C69,D1
`Chr8:57849232`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B120,B14,B19,B26,B42,B43,B58,B60,C18,C46,C55,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781064.1

498 aa

249

498

AA_permease_2

AA_permease

PF13520 AA_permease_2 62-474 aa PF00324 AA_permease 84-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781064.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	62	474	2.4e-32	113.1	Amino acid permease
`XP_057781064.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	84	462	4.2e-17	62.7	Amino acid permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925081.1
TAATATCCACCGTTCCACCATTTTTTTAAAAAATCCTATTGTTTAAAAAGTGATAACGATATCGTGAACGGAAAGAGTATAATTTAATAATTGAATATGGATATTAATAGATTAGAAGTGTGAATTATTAAGTGTGCCTAAGTAGAAATAAATGAGTGTATAAGTCAAATAAAATTAGGAATAGAAGATGTCGAACGTTGACAAACACTTCATTTTGAAAAAATTTCAAAAGAAAAAGTTAAATTAAATTTATGTGTATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999530
ATGTGTATATATATCCATACCATTACCATATCAAATATGGTCAAAATTTTCCCACAAAAAGAATCTCAAGATTCGTATCTCTTCAATTCAATGACCAATCAACCAGCAGCGGCGCAGCCGCCAACCGCCACCGACGACATCCCCACCACCACCGCTGCGAAGCCCTCCAAGTCGAAGAAGCTGACCCTCCTCCCCCTCATCTTCCTCATCTACTTCGAAGTCGCCGGCGGCCCCTACGGCGAGGAGCCCGCCGTGCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781064.1
MCIYIHTITISNMVKIFPQKESQDSYLFNSMTNQPAAAQPPTATDDIPTTTAAKPSKSKKLTLLPLIFLIYFEVAGGPYGEEPAVQAAGPLFAILGFLIFPFIWSIPEALITAELSTAFPGNGGFVIWADRAFGPFFGSLMGTWKFLSGVINIAAFPALCIDYLKRIFPIFESGKPRTLAILISTAFLSFLNYTGLAIVGYVAVALGVISLAPFLLMSAIAIPQIHPRRWISLGQSGVKKDWNLFFNTLFWNLNFWDNVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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