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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004888`

染色体: Chr08 坐标: 57933206-57935553 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004888`
名称	SmilChr08G004888
描述	FHA domain-containing protein FHA2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	57933206 - 57935553 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999542`
GeneID	`130999542`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999542`
原始查询	`LOC130999542`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FHA domain-containing protein FHA2-like
产物	FHA domain-containing protein FHA2-like
Arabidopsis	`AT3G07220` (FHA2) SMAD/FHA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819910] identity=66.1; qcov=0.991; evalue=3.14e-150; confidence=high
Rice	`Os08g0528900` - identity=63.6; qcov=1.02; evalue=1.81e-143; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0060962 (regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II)
KEGG	-
Pfam	PF00498 (FHA); PF31130 (FHA2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999542

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781077.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057781077.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781077.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781077.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781077.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:57933500`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:57934301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B20,C26,C34,C9,D5
`Chr8:57935087`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:57935167`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:57935257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C38
`Chr8:57935314`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:57935356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B108,B119,B135

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781077.1

342 aa

171

342

FHA

FHA2_C

PF00498 FHA 28-102 aa PF31130 FHA2_C 238-339 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781077.1`	Pfam	`PF00498`	FHA	Family	28	102	1.2e-11	45.6	FHA domain
`XP_057781077.1`	Pfam	`PF31130`	FHA2_C	Domain	238	339	4.4e-51	171.8	FHA domain-containing protein FHA2 C-terminal winged HTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925094.1
GATAAGTTCATAATTTTCCACAATTCTCCACCAAGCCAAACGCCCCCTAACAACGATTACCCCCAAATCAATTTCCCCGAGTCCGACGATCTGAGCCCTAATTCCGCAGCGATGAGCAGTAGCGACGTGGAGGCCGGCTTCGCGAAGCTGCAAGGCGAGGATTTCGAGTACTACATGCAGACCTACTCGATTATCCTCGGCCGCAACTCCAAGAAATCGTCCGTGGACGTCGACCTCTCGTCGCTCGGCGGCGGGATGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999542
ATGAGCAGTAGCGACGTGGAGGCCGGCTTCGCGAAGCTGCAAGGCGAGGATTTCGAGTACTACATGCAGACCTACTCGATTATCCTCGGCCGCAACTCCAAGAAATCGTCCGTGGACGTCGACCTCTCGTCGCTCGGCGGCGGGATGAACATCAGCCGCCACCACGCCCGCATCTTCTACGACTTCCAGCGCCGCCGCTTCGCCCTCGAGGTGCTCGGCAAGAACGGCTGCTTCGTCGAAGGCGTCCTCCACCTCCCCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781077.1
MSSSDVEAGFAKLQGEDFEYYMQTYSIILGRNSKKSSVDVDLSSLGGGMNISRHHARIFYDFQRRRFALEVLGKNGCFVEGVLHLPGNPPVKLDSQDLLQIGDKEFYFLLPVRSILGGPIGPRHHTPNFPIGGPAAAAAAQHHLGLPPPPVGGGVGFGKKGRGRGEYYEDEYNEEDGGGGGEEGSSGGKRMRRIDGGIDGSGGGGYSYGSGGKAGGSGQLDKKSDGRPRIDREADNQQLLQLEEKDVVSSVATVLSDLCG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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