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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004113`

染色体: Chr01 坐标: 59653166-59658647 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004113`
名称	SmilChr01G004113
描述	E3 ubiquitin protein ligase DRIP2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59653166 - 59658647 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999567`
GeneID	`130999567`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999567`
原始查询	`LOC130999567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin protein ligase DRIP2
产物	E3 ubiquitin protein ligase DRIP2
Arabidopsis	`AT2G30580` (DRIP2) DREB2A-interacting protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817608] identity=54.4; qcov=1; evalue=1.01e-142; confidence=high
Rice	`Os03g0632800` (OsRFP) - identity=50; qcov=0.811; evalue=8.59e-95; confidence=high
GO	GO:0004842 (ubiquitin-protein transferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX); PF13923 (zf-C3HC4_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999567

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781111.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057781111.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057781111.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057781111.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59655030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B61
`Chr1:59655050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:59655305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:59655820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:59655975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C33,C67,C82
`Chr1:59658178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,C43,C9,D4
`Chr1:59658203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781111.1

424 aa

212

424

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

zf-C3HC4_2

PF13445 zf-RING_UBOX 19-55 aa PF00097 zf-C3HC4 19-59 aa PF13923 zf-C3HC4_2 19-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781111.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	19	55	1.2e-06	29.2	RING-type zinc-finger
`XP_057781111.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	19	59	2.1e-06	28.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057781111.1`	Pfam	`PF13923`	zf-C3HC4_2	Domain	19	59	9e-08	32.5	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925128.1
AGTTTAAAAAGTCTATATTTTGGTTCATGCTGATTGTAACAACAAAGCCCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTTTCTCTCTCTCTGTCTCTCGATTTCGACTCCTCCCCCGCACCGCACACACAGAACACGCACTCACAGATCATCCACAAGGCTTCAGCCTTCAGCCCACGTCCCCGTTTCCCCCAAATCACCTCTTCCCGAATCAGTCCTCGATTTGCAGGCGCAGTAGAGAGAGAAAGGAAACGGACGTAAATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999567
ATGTCGCACCAGGTGGTTGAGGTGAGGAGGGAGGCGGTGGCGCCATGCATGACATGCCCTCTCTGCCACAAGCTCTTCCGCGACGCCACTACAATTATCGAATGCCTCCACACTTTTTGCAGGAAATGCATATACAAGAAGCTCTCAGACGAGGAAATGGAATGTTGCCCAATATGCAATATCGACTTGGGATGTGTACCATTGGAGAAGTTGAGGCCGGATCATAATTTGCAAGACGTGAGGGCAAAAATATTTCCACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781111.1
MSHQVVEVRREAVAPCMTCPLCHKLFRDATTIIECLHTFCRKCIYKKLSDEEMECCPICNIDLGCVPLEKLRPDHNLQDVRAKIFPHKRIKVKAPEVVTPVALPAKRKERSLSSLVVSTPRVSAQVGMTGRRSKSVARKASRGSSFTIEKPVVNSVEDQPESSSSQEMLNKSTHNNRQNSSAGEPSNHSPNKERENCSEHWEGKVDLWKPLTCLVEAANRSKSSKFNTQDSHVKSEEQNPYEKEGLLRKTKNKEQRKKSK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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