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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004917`

染色体: Chr08 坐标: 58125224-58127193 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004917`
名称	SmilChr08G004917
描述	uncharacterized SmilChr08G004917
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58125224 - 58127193 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999568`
GeneID	`130999568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999568`
原始查询	`LOC130999568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0508600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0508600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27990` (AT5G27990) Pre-rRNA-processing protein TSR2, conserved region [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832869] identity=35.8; qcov=0.985; evalue=3.9e-30; confidence=medium
Rice	`Os08g0508600` - identity=34.3; qcov=0.971; evalue=8.24e-31; confidence=low
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF10273 (WGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781108.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781108.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781108.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781108.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58125428`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr8:58125428`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr8:58125432`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A20
`Chr8:58125432`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A20
`Chr8:58125470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B63,B77,C53,C69
`Chr8:58125503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B122,B2,B59,B7
`Chr8:58125536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B56,B96
`Chr8:58125540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A13,B125
`Chr8:58125540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,B125
`Chr8:58125572`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B83,C45,C74
`Chr8:58126024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B23
`Chr8:58127009`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B2,B42,B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781108.1

204 aa

102

204

WGG

PF10273 WGG 14-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781108.1`	Pfam	`PF10273`	WGG	Family	14	93	4.4e-22	79.0	Pre-rRNA-processing protein TSR2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925125.1
ATATGAAATGAGCCCAAACCCTTCTGTTCTTCTTCACTTGCGCACAAACGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCCTTCAGCGATGAACCCCCACAGTATGACGCCGGAGGCGGCGGCGCAATTCGGCGATGGAATTCATCTGGTGCTTTCTCGGTGGGCTGCACTGCGGATGGCCATCGAAAACGAGTGGGGCGGCCGCGACACTCTCCAGAAATCGCAGCAGCTCCGCCACAATCTCTTCAATTTCCTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999568
ATGAACCCCCACAGTATGACGCCGGAGGCGGCGGCGCAATTCGGCGATGGAATTCATCTGGTGCTTTCTCGGTGGGCTGCACTGCGGATGGCCATCGAAAACGAGTGGGGCGGCCGCGACACTCTCCAGAAATCGCAGCAGCTCCGCCACAATCTCTTCAATTTCCTAACTCAATCAAAAGCTCAAGTATATATTGATGATGTAGAGGATATACTTTTTGAATTCATGGACTCTCTCAATACTGAGATTGAGGATGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781108.1
MNPHSMTPEAAAQFGDGIHLVLSRWAALRMAIENEWGGRDTLQKSQQLRHNLFNFLTQSKAQVYIDDVEDILFEFMDSLNTEIEDGSVDEVSEKLMVMREECLEGKFDSIKKLRETDAPSISYTRQANSDDEEDSDEDDADNATMENNSSAMEVDAPHPQPQRQCQLSLGRKDAVADETSTKDASEVVDGWTVVSSRRSKGRKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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