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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004114`

染色体: Chr01 坐标: 59668674-59671246 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004114`
名称	SmilChr01G004114
描述	probable WRKY transcription factor 21
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59668674 - 59671246 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999577`
GeneID	`130999577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999577`
原始查询	`LOC130999577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 21
产物	probable WRKY transcription factor 21
Arabidopsis	`AT2G30590` (WRKY21) WRKY DNA-binding protein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817609] identity=54.7; qcov=1.09; evalue=6.21e-124; confidence=high
Rice	`Os12g0597700` (OsWRKY94) - identity=51.6; qcov=1.07; evalue=2.83e-108; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY); PF10533 (Plant_zn_clust)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781125.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781125.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781125.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781125.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59670022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:59670043`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B140,C84
`Chr1:59670803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B118,B27,C44,C47,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781125.1

352 aa

176

352

Plant_zn_clust

WRKY

PF10533 Plant_zn_clust 237-282 aa PF03106 WRKY 286-343 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781125.1`	Pfam	`PF10533`	Plant_zn_clust	Domain	237	282	7.6e-18	65.1	Plant zinc cluster domain
`XP_057781125.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	286	343	1.3e-27	96.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925142.1
AGAGACGGCAGTTTCACTTCCCAGCTTTCTCTCTCATGCTGCCGCAGATTTATATATTAATGCCATCATCTCCCTCTCTCTCTAGAATTACGCATTTATTGCTCTCTCACTAGCAATAATTTGCAACTCTAGGACTATAAATATTTCAAAGATTGCATCTTTTTGTAATTTCATTTTCTGGGTCGTGTCAATTCTCTGCCAAAGCGAAGCAAAAAAGTCTTCTCTTTCACACCTTTCAATCCCATAAACGTAACACACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999577
ATGATGGAGGAGGTTGAAAAGGCAAATATTGCAGCTGTGGAGAGCTGCCATAGAGTGATTAACATTTTAAACCAAGCTCAAGATCAAAATTTGAGTGGAAATTTAGTGGAACAAACAGGGGAAGCTGTGCAGAGATTCAAGAAAGTTGTCTCTCTCCTCAACTCGAGCTGTGGCCATGCTAGAGTGAGAAAAAGTAGGAAAATCCAACCTCCTTTTCCTCCAAACATATTCCTTGAAACCCCCATTTTCCGAAACGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781125.1
MMEEVEKANIAAVESCHRVINILNQAQDQNLSGNLVEQTGEAVQRFKKVVSLLNSSCGHARVRKSRKIQPPFPPNIFLETPIFRNDDHRHHQQPKPLHLLQINPVDTNRRQESVSIAKNSLTLGNPSLELSSHGKNLRLSQQTPLPNYHFLQQQQRFQLQQQQQQLKQQQQAELVYRRSNSGISLNFDSSSCTPTMSSTRSFISSLSMDGSVANVDGSAFRLIGAARSADQASFHHKRRCAGRGEDGSVKCGGSGRCHCS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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