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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004931`

染色体: Chr08 坐标: 58209218-58211229 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004931`
名称	SmilChr08G004931
描述	uncharacterized SmilChr08G004931
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58209218 - 58211229 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999584`
GeneID	`130999584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999584`
原始查询	`LOC130999584`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT1G55340; symbol=AT1G55340; hit=AT1G55340; species=arabidopsis; confidence=high
产物	AT1G55340; symbol=AT1G55340; hit=AT1G55340; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G55340` (AT1G55340) - identity=56.1; qcov=1.01; evalue=3.6e-69; confidence=high
Rice	`Os03g0807200` - identity=50.5; qcov=1.03; evalue=5.33e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07797 (DUF1639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781133.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781133.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781133.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781133.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057781133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58209718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr8:58209720`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98
`Chr8:58209720`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B98
`Chr8:58210432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:58210525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:58210582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:58210849`	`AGT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	56	A14,A8,A9,B103,B105,B108,B110,B111,B119,B125,B130,B134,B135,B14,B15,B19,B31,B4,B40,B5,B52,B54,B57,B64,B69,B81,B84,B87,B89,B90,B92,B95,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C26,C28,C33,C36,C38,C46,C51,C52,C55,C58,C59,C6,C71,C79,C84,C9,D1,D9
`Chr8:58210866`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	143	A1,A14,A19,A21,A22,A23,A24,A3,A4,A6,A8,B100,B101,B102,B107,B11,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B128,B129,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B28,B29,B3,B33,B36,B4,B40,B41,B44,B49,B5,B50,B51,B54,B6,B61,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B8,B81,B83,B85,B87,B88,B9,B94,B97,C1,C11,C13,C14,C15,C16,C18,C2,C23,C25,C26,C30,C31,C32,C34,C35,C4,C40,C42,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C53,C54,C55,C57,C59,C60,C61,C62,C64,C66,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C76,C8,C80,C81,C83,C85,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D8,D9
`Chr8:58210875`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A14,A15,A19,A8,A9,B103,B105,B108,B110,B111,B119,B125,B130,B131,B134,B135,B14,B15,B19,B31,B4,B40,B5,B52,B54,B57,B64,B69,B83,B84,B87,B89,B90,B92,B95,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C26,C27,C28,C33,C36,C38,C46,C51,C52,C55,C58,C59,C6,C64,C66,C71,C73,C79,C84,C9,D1,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781133.1

241 aa

120

241

DUF1639

PF07797 DUF1639 135-184 aa

XP_057781134.1

210 aa

105

210

DUF1639

PF07797 DUF1639 135-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781133.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	135	184	5e-23	81.5	Protein of unknown function (DUF1639)
`XP_057781134.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	135	184	4e-23	81.9	Protein of unknown function (DUF1639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925151.1
TTTCTCTTTTTTTCCTTCTTCTGTAATTTCATTTTTTCGCTTTTTGGTCTAAGTTTTAAACTTCTTTTGAGGTGCTTCTCTTCGAACAAAAACTCCCTCATTCTTTCAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGACTTATACATATACAGATATACTAGACATACGCATATAGTATTCTGCTGTTTTTGGTGCATGGGAATGGGATTGTGCTGATTGTATCATTGTTAGATTTGGGAAAAACTGGTTGCTTTTACACAATAT...

XM_057925150.1
TGTAATTTCATTTTTTCGCTTTTTGGTCTAAGTTTTAAACTTCTTTTGAGGTGCTTCTCTTCGAACAAAAACTCCCTCATTCTTTCAATCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGACTTATACATATACAGATATACTAGACATACGCATATAGTATTCTGCTGTTTTTGGTGCATGGGAATGGGATTGTGCTGATTGTATCATTGTTAGATTTGGGAAAAACTGGTTGCTTTTACACAATATTTGAAGAATAACTAGTGTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999584
ATGGATAAGCTGCAGTGGGGGAATAGAAAGAGGCTGAGGTGTGTGAAAGTGAAAGACTCGCCTTTGAGCGGAAAATCAGACGGCGGCGGCGCCGCTGTGGTCAAGAAGAAAATCACTTCAAGAGTGGTGGATAATAACCTTAGTAATAATGTTAATAATTGCAGTAAAGATGGGAATGCTCTTCCTCCAGTTCCCTCTCCTCTCCGTTCCACCAGGGACTTAGGTGCGAGTAGATCTATTGCAAATGATAACCGAAAAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781133.1
MDKLQWGNRKRLRCVKVKDSPLSGKSDGGGAAVVKKKITSRVVDNNLSNNVNNCSKDGNALPPVPSPLRSTRDLGASRSIANDNRKASTSLSPEKEDRYYTTRGSGGFDDATKALFANPKEENRKVVWPKLLIALSSKEKEEDFMAMKGCKPPQRPKKRAKLIQRTILLVSPGAWLTDLCQERYEVREKKTSKKVNKPWYMLLGLGPSLSVFEECDEFWMCDLLQKPRGLKAMGTVESDSE

XP_057781134.1
MDKLQWGNRKRLRCVKVKDSPLSGKSDGGGAAVVKKKITSRVVDNNLSNNVNNCSKDGNALPPVPSPLRSTRDLGASRSIANDNRKASTSLSPEKEDRYYTTRGSGGFDDATKALFANPKEENRKVVWPKLLIALSSKEKEEDFMAMKGCKPPQRPKKRAKLIQRTILLVSPGAWLTDLCQERYEVREKKTSKKKPRGLKAMGTVESDSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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