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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G004118`

染色体: Chr01 坐标: 59711147-59712513 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G004118`
名称	SmilChr01G004118
描述	histone H1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	59711147 - 59712513 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999600`
GeneID	`130999600`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999600`
原始查询	`LOC130999600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H1-like
产物	histone H1-like
Arabidopsis	`AT2G30620` (AT2G30620) winged-helix DNA-binding transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817612] identity=53.9; qcov=0.824; evalue=1.32e-45; confidence=medium
Rice	`Os03g0799000` (OSJNBa0052F07.24) - identity=73.7; qcov=0.268; evalue=1.33e-30; confidence=weak
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030261 (chromosome condensation); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0031492 (nucleosomal DNA binding); GO:0045910 (negative regulation of DNA recombination)
KEGG	-
Pfam	PF00538 (Linker_histone)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999600

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781159.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057781159.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057781159.1`
4	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057781159.1`
5	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057781159.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:59711546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C26,C84
`Chr1:59711553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:59711773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A5
`Chr1:59711780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B39,B74,C26
`Chr1:59711798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:59711816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C84
`Chr1:59711871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr1:59711927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C28
`Chr1:59711960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C84
`Chr1:59711990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr1:59712054`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B10,B133,B138,B25,B29,B59,C47,C71,D7
`Chr1:59712078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781159.1

284 aa

142

284

Linker_histone

PF00538 Linker_histone 64-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781159.1`	Pfam	`PF00538`	Linker_histone	Domain	64	130	2.4e-18	66.8	linker histone H1 and H5 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925176.1
AACAAGCTTTGCTAAGCCTTTCAATCCATGCGCTTTCCTTTAAACGCAGGCCACCGTAGATTGAAATCCATCTAACGGCTCATATTCAAAATTTCTCCATATCTTTAATCCGCGTGAACCAGCTTTCAACCAATCATATTTCGTCTTGTCGGAATGAAATCCAACTCTCACTATTTAAATCCACCCATATTTTCTGCGTAAAAACCACACACACAAATTTCGATCTAGATTCCCTCATTTTCCTCAATTTCCTTAAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999600
ATGGCCACCACCGAAGAGCCGATTCTGTCGAGCGAGCCAGCGGTGGAGCCGACTGCCGCCGCAGAACCTGCGGAGGAGACAGCGAAAGATGAGAATCCTACGGAGAAATCCGTCACGGTGAAGAAGGTTTCTGCTCCAAAAGATGCTAAGAAGAAGGTTCCTGCTCCGAGAAAGCGTAGCTCCTCCACTCACCCTCCTTATTTTGAGATGATTAAAGATGCAATCGTCACGCTCAAGGAGAGGACAGGATCGAGCCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781159.1
MATTEEPILSSEPAVEPTAAAEPAEETAKDENPTEKSVTVKKVSAPKDAKKKVPAPRKRSSSTHPPYFEMIKDAIVTLKERTGSSQYAITKFIEDKEKNLPANFRKVLLVQLKKLVANEKLAKVKNSFKLPSARTPKPVPAAAAPTKKKPATAAKPKLKAAAAKEKKVSAVKAKPKPKPKTVAAKPKAAVKAKPAAKPKAAAPVKAKAAPKRKAAETAKKPPAKATRTSTRTNPGRKTAAIDAIKKAPVAKKATPVKKAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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