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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004956`

染色体: Chr08 坐标: 58407982-58410852 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004956`
名称	SmilChr08G004956
描述	transcription factor Pur-alpha 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58407982 - 58410852 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999601`
GeneID	`130999601`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999601`
原始查询	`LOC130999601`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor Pur-alpha 1
产物	transcription factor Pur-alpha 1
Arabidopsis	`AT2G32080` (PUR ALPHA-1) purin-rich alpha 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817768] identity=78.3; qcov=0.961; evalue=7.6e-153; confidence=high
Rice	`Os01g0260700` - identity=75.6; qcov=0.972; evalue=4.82e-150; confidence=high
GO	GO:0000977 (RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0032422 (purine-rich negative regulatory element binding)
KEGG	-
Pfam	PF04845 (PurA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999601

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057781156.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057781156.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057781157.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781156.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781156.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58408376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B100,B120,C48
`Chr8:58409878`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr8:58409919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,B76
`Chr8:58410080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr8:58410293`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B139,B31,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781156.1

286 aa

143

286

PurA

PF04845 PurA 21-147 aa PF04845 PurA 207-262 aa

XP_057781157.1

284 aa

142

284

PurA

PF04845 PurA 21-147 aa PF04845 PurA 202-260 aa

XP_057781158.1

283 aa

142

283

PurA

PF04845 PurA 21-147 aa PF04845 PurA 204-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781156.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	21	147	1.1e-36	127.0	PurA ssDNA and RNA-binding protein
`XP_057781156.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	207	262	1.1e-36	127.0	PurA ssDNA and RNA-binding protein
`XP_057781157.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	21	147	5.6e-37	127.9	PurA ssDNA and RNA-binding protein
`XP_057781157.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	202	260	5.6e-37	127.9	PurA ssDNA and RNA-binding protein
`XP_057781158.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	21	147	1.1e-36	126.9	PurA ssDNA and RNA-binding protein
`XP_057781158.1`	Pfam	`PF04845`	PurA	Family	204	259	1.1e-36	126.9	PurA ssDNA and RNA-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925173.1
TTGAGTGGAGGGGAAAAGGGCACAATTGGAAATTGGGAATTAGGGGCTGGCAAGTTGGCGGAGGTGGACGCCATGTGGTGAGCAGCCGCAACCGCAAGCCTTCCCCAAAATTAGATAACGCAACGCAATTCACACTGACCTAAATTAAGCTACGGCTTTCCTCCTCCGACCTCTCCCCTCAAAACCCTATCGCGCCGCCGTCTCTCCAATTACGCTCGCCAATTTTCAATTTTTTGGATTGTCAAGGTCGTCGCCGGACG...

XM_057925175.1
AGTGGAGGGGAAAAGGGCACAATTGGAAATTGGGAATTAGGGGCTGGCAAGTTGGCGGAGGTGGACGCCATGTGGTGAGCAGCCGCAACCGCAAGCCTTCCCCAAAATTAGATAACGCAACGCAATTCACACTGACCTAAATTAAGCTACGGCTTTCCTCCTCCGACCTCTCCCCTCAAAACCCTATCGCGCCGCCGTCTCTCCAATTACGCTCGCCAATTTTCAATTTTTTGGATTGTCAAGGTCGTCGCCGGACGCCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130999601
ATGGAGGGGAATTCTTCCGGTGGTGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGGGGGAATGATGTGGAGCTGCTGTGCAAAACACTGCAGGTGGAGCACAAGCTATTCTACTTCGACCTCAAGGAGAATCCCCGTGGGCGTTACCTCAAGATCTCCGAGAAGACTTCGGCGACAAGGTCCACCATCATAGTACCTTCCAACGGCATCGCCTGGTTCCTCGATCTCTTCAATTACTATGTCAATTCTGATGACCAGGATGTCTTTAGCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057781156.1
MEGNSSGGGGGGGGGGNDVELLCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPSNGIAWFLDLFNYYVNSDDQDVFSKELQLDTKVFYFDVGENRRGRFLKISEASVSRNRSTIIVPAGSARDEGWAAFRNILGEINETSRLVILPNQHQQNSEVPERLVGLSDDVGAGFISSHSSQSAPAADLNVDRSSDLPPPDDIVSKVIRADQKKFFFDLGSNNRGHFLRISEVTGSDRSSIILPLSGLKQFHEMVG...

XP_057781157.1
MEGNSSGGGGGGGGGGNDVELLCKTLQVEHKLFYFDLKENPRGRYLKISEKTSATRSTIIVPSNGIAWFLDLFNYYVNSDDQDVFSKELQLDTKVFYFDVGENRRGRFLKISEASVSRNRSTIIVPAGSARDEGWAAFRNILGEINETSRLVILPNQQNSEVPERLVGLSDDVGAGFISSHSSQSAPAADLNVDRSSDLPPPDDIVSKVIRADQKKFFFDLGSNNRGHFLRISEVTGSDRSSIILPLSGLKQFHEMVGHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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