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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004949`

染色体: Chr08 坐标: 58366344-58367468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004949`
名称	SmilChr08G004949
描述	uncharacterized protein At5g19025-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58366344 - 58367468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999604`
GeneID	`130999604`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999604`
原始查询	`LOC130999604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0815100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0815100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G01170` (AT3G01170) Ribosomal protein L34e superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820469] identity=41.3; qcov=1.05; evalue=3.39e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0815100` - identity=46.1; qcov=1.03; evalue=2.46e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF28125 (At5g19025_N); PF30682 (At5g19025_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999604

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057781169.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057781169.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057781169.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057781169.1`
5	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057781169.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58366697`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	94	A1,A11,A13,A14,A18,A23,A6,A7,A9,B1,B10,B102,B105,B11,B117,B12,B120,B121,B123,B126,B128,B129,B134,B139,B14,B140,B15,B17,B18,B19,B2,B23,B28,B36,B37,B39,B44,B45,B46,B47,B49,B5,B55,B56,B58,B59,B68,B70,B71,B77,B79,B80,B82,B84,B9,B92,B94,B98,C10,C11,C16,C18,C19,C2,C22,C23,C25,C26,C3,C37,C4,C40,C47,C48,C5,C50,C53,C54,C63,C65,C69,C72,C73,C75,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D2,D8
`Chr8:58366741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,C87
`Chr8:58366746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B67
`Chr8:58366758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B55,C40
`Chr8:58366769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:58366838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,B43,B80
`Chr8:58367012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:58367282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B122,B83,C28,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781169.1

215 aa

108

215

At5g19025_N

At5g19025_C

PF28125 At5g19025_N 48-112 aa PF30682 At5g19025_C 132-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781169.1`	Pfam	`PF28125`	At5g19025_N	Domain	48	112	3.7e-13	50.8	At5g19025 N-terminal domain
`XP_057781169.1`	Pfam	`PF30682`	At5g19025_C	Domain	132	203	5e-15	55.6	At5g19025 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925186.1
AAGTGTTGGATCGATATAGTTTGGGGGGCAAACTGTAATTAAAGGAAAATCCAATGCGTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTCTTTTCGTTTCTTCTGGTAAATGCTATTCAATTGAATTGCATCATCACAATTCAGACCATTCTCAACAAAGTCAATTAGTCATCCTTCTCAACTTCTGCTGCTATCCGATTGCAGTAATCCAACACCAAATTCAATTCAATCTCCCTTTCCAATTCAATCCACACCTCTATTTAATTCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999604
ATGAGGCTGCCGATGGTCGATTGCCGGAGTTTGATCCAGTTCTGCCGAGCTTTCCCCCCTCGCAACACCACCAATTTCACGAATCCGAGCCGCCGCCGCGCCGATTCTCTGAACGAATTCTGCCACCGCTCCCCGCTGGCCGCCGTCGATCTGGTCATACTCGTGTTGGTGATTGTCTCGTCCGCGTTCCTGATCCTTCCTTACATGAAACTATTCGCGTTCGAGCTTGTGCCGGCGGCTCACGGCGCGATCGTTGACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781169.1
MRLPMVDCRSLIQFCRAFPPRNTTNFTNPSRRRADSLNEFCHRSPLAAVDLVILVLVIVSSAFLILPYMKLFAFELVPAAHGAIVDLILEEPVPYAVGFVTVVVGVIVAVLIDLRMRKCGNPKCKGLRRAVEYDIQLETEACVKHSPPPLHVDAYRELNGMRELELGEDRKELEAELKKMAPVNGRTVLIFRAPCGCPLGRMEVWGHKKIRRIKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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