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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004961`

染色体: Chr08 坐标: 58423184-58428100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004961`
名称	SmilChr08G004961
描述	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58423184 - 58428100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999610`
GeneID	`130999610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999610`
原始查询	`LOC130999610`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3, chloroplastic
产物	protein ACTIVITY OF BC1 COMPLEX KINASE 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G79600` (AT1G79600) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844298] identity=74.5; qcov=0.963; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0323800` (OsAGSW1) - identity=80.4; qcov=0.904; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF03109 (ABC1); PF30507 (ABC1K3_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057781177.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057781177.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057781177.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057781177.1`
5	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057781177.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58423537`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B110,B40,B5
`Chr8:58424329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B67,B88,C85
`Chr8:58424815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:58426364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,D11
`Chr8:58427037`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B38,B39,B81,B97,C35
`Chr8:58427102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:58427219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:58427222`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C43,C6,C71
`Chr8:58427340`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	B1,B113,B114,B117,B123,B20,B24,B30,B35,B60,B64,B66,B75,B77,B87,B94,B98,C18,C34,C37,C64,C66,C67,D1,D2
`Chr8:58427469`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	29	A10,A7,B1,B114,B117,B123,B133,B135,B16,B18,B24,B33,B35,B53,B7,B76,B77,B79,B84,B89,C18,C37,C42,C57,C59,C65,C70,D1,D4
`Chr8:58427738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:58427755`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781177.1

707 aa

354

707

ABC1

ABC1K3_C

PF03109 ABC1 180-424 aa PF30507 ABC1K3_C 579-696 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781177.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	180	424	7.5e-77	258.5	ABC1 atypical kinase-like domain
`XP_057781177.1`	Pfam	`PF30507`	ABC1K3_C	Domain	579	696	3.7e-31	108.7	ABC1 kinase 3, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925194.1
ATTTAGATTAGATATGCGAAGTTGGGCACGTCACGTGGGTGTGGGTGTGGATGCGAACACGTCACAAGCAGTGGAAATTATCACAAATAAATGAGAATGGTGGACTAGAATTGGAAATTTCGCTGATTTGCAGATGAGTACCGCTACGGTATCTGTTGTGGGTCCGGCGAATTGGGGTCAGAGGAGGGGAAGGGCAAAGTTAAGTACGCCGCGAGCGGCTCTGGTGGAGGCGAAGCCCCGATCGCTGCCAGCTCTCAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999610
ATGAGTACCGCTACGGTATCTGTTGTGGGTCCGGCGAATTGGGGTCAGAGGAGGGGAAGGGCAAAGTTAAGTACGCCGCGAGCGGCTCTGGTGGAGGCGAAGCCCCGATCGCTGCCAGCTCTCAGAGGAGGCGATGAAGAGAAGGGCGTTGTAACTCTTGCCCGACTCAGAGATTCCTCCGGCGCCGGCCCCGGCCCCTCTTCTAGAGACCGAGCCGATGATATGCAAGCAGAAGCGGCGGCAATGGCTCGAGCCGCTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781177.1
MSTATVSVVGPANWGQRRGRAKLSTPRAALVEAKPRSLPALRGGDEEKGVVTLARLRDSSGAGPGPSSRDRADDMQAEAAAMARAANASVYSAELLSGKYGSRPIRVAQRALEIFAGLGSFALNLWLDQLRGQLDRNQRQRAVHLRNTFTRLGPTFVKIGQGLSTRPDLCPPLYIEELSQLQDALPTFPDAEAFSCIERELGCSLDSVYSSISASPIAAASLGQVYKAQLKCSGQVVAVKVQRPGIEEAIGLDFYLIRGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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