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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004960`

染色体: Chr08 坐标: 58419354-58422915 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004960`
名称	SmilChr08G004960
描述	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	58419354 - 58422915 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999612`
GeneID	`130999612`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999612`
原始查询	`LOC130999612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier-like
产物	peroxisomal nicotinamide adenine dinucleotide carrier-like
Arabidopsis	`AT2G39970` (PXN) Mitochondrial substrate carrier family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818584] identity=58.8; qcov=0.974; evalue=1.47e-127; confidence=high
Rice	`Os09g0508900` - identity=71; qcov=0.948; evalue=9.58e-161; confidence=high
GO	GO:0006862 (nucleotide transport); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00153 (Mito_carr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999612

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	0.80000	`XP_057781179.1`
2	Peroxisome membrane	过氧化物酶体膜	0.80000	`XP_057781179.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057781179.1`
4	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057781179.1`
5	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057781179.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:58419489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B100,C48
`Chr8:58420034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr8:58420451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,C12
`Chr8:58421282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:58421512`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,D11
`Chr8:58422659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C77
`Chr8:58422723`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B8
`Chr8:58422723`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B8
`Chr8:58422738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781179.1

349 aa

174

349

Mito_carr

PF00153 Mito_carr 4-94 aa PF00153 Mito_carr 181-238 aa PF00153 Mito_carr 251-342 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781179.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	4	94	1.6e-52	175.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057781179.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	181	238	1.6e-52	175.9	Mitochondrial carrier protein
`XP_057781179.1`	Pfam	`PF00153`	Mito_carr	Repeat	251	342	1.6e-52	175.9	Mitochondrial carrier protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925196.1
AATAAAAATAAAAAAGTTGAGAGGATAAGAGCGTGTGAAATTGAGTGGAAGCAAGAGAATGTCGAACGCCATAGTGAATGGGATTGCCGGAGCTGGCGGAGGTATTGTTGCCCAGATCATTACTTACCCTCTGCAGACGGTGAATACACGGCAGCAGACAGAGAGAGTTGCTAAGGCCTCAATTCCATGTGCATCACCTCCTCGGAACACTCTCGTTCAGATTTTTCAGCTCATTAGAAGTGAAGGCATCGGAGGGCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999612
ATGTCGAACGCCATAGTGAATGGGATTGCCGGAGCTGGCGGAGGTATTGTTGCCCAGATCATTACTTACCCTCTGCAGACGGTGAATACACGGCAGCAGACAGAGAGAGTTGCTAAGGCCTCAATTCCATGTGCATCACCTCCTCGGAACACTCTCGTTCAGATTTTTCAGCTCATTAGAAGTGAAGGCATCGGAGGGCTTTACAGCGGCCTCAAGCCATCTCTGCTGGGCACTGCTGCTTCTCAGGGAATCTATTACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781179.1
MSNAIVNGIAGAGGGIVAQIITYPLQTVNTRQQTERVAKASIPCASPPRNTLVQIFQLIRSEGIGGLYSGLKPSLLGTAASQGIYYSFYQAFKNKAVAVALANKRKGRGDGTPGMLSWLIVAALAGSLNVLLTNPIWVLVTRMQTYTQAERKIVEAKKEALLKEASENVLSRSSLATQLAQLDSIKPRPYGTFQAACEVYNESGIAGFWKGIIPTLIMVCNPSIQFMIYESLLKRLRSKRSAKKQGSTNIKAVEIFVVGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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