当前解析结果
SmilChr08G003671| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003671 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003671 |
| 描述 | aluminum-activated malate transporter 8-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 40665443 - 40668681 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130999615 |
|---|---|
| GeneID | 130999615 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130999615 |
| 原始查询 | LOC130999615 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | aluminum-activated malate transporter 8-like |
| 产物 | aluminum-activated malate transporter 8-like |
| Arabidopsis | AT2G27240 (AT2G27240)aluminum activated malate transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817266] identity=46; qcov=0.978; evalue=3.47e-130; confidence=high |
| Rice | Os04g0417000 (OsALMT1)- identity=45.4; qcov=0.998; evalue=2.95e-121; confidence=high |
| GO | GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130999615 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057781182.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057781182.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057781182.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057781182.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057781182.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:40667400 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057781182.1PF11744
ALMT 18-356 aa
PF13515
FUSC_2 55-180 aa
XP_057781183.1PF11744
ALMT 18-211 aa
PF13515
FUSC_2 55-180 aa
PF11744
ALMT 212-346 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057781182.1 |
Pfam | PF11744 |
ALMT | Family | 18 | 356 | 9.7e-134 | 447.5 | Aluminium activated malate transporter |
XP_057781182.1 |
Pfam | PF13515 |
FUSC_2 | Family | 55 | 180 | 1.9e-09 | 38.4 | Fusaric acid resistance protein-like |
XP_057781183.1 |
Pfam | PF11744 |
ALMT | Family | 18 | 211 | 4.7e-126 | 422.2 | Aluminium activated malate transporter |
XP_057781183.1 |
Pfam | PF13515 |
FUSC_2 | Family | 55 | 180 | 1.8e-09 | 38.5 | Fusaric acid resistance protein-like |
XP_057781183.1 |
Pfam | PF11744 |
ALMT | Family | 212 | 346 | 4.7e-126 | 422.2 | Aluminium activated malate transporter |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。