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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G004587`

染色体: Chr08 坐标: 55442429-55445885 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G004587`
名称	SmilChr08G004587
描述	uncharacterized SmilChr08G004587
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	55442429 - 55445885 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999616`
GeneID	`130999616`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999616`
原始查询	`LOC130999616`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	G-box regulating factor 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830909]; symbol=GRF6; hit=AT5G10450; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	G-box regulating factor 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830909]; symbol=GRF6; hit=AT5G10450; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G10450` (GRF6) G-box regulating factor 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830909] identity=78.9; qcov=0.292; evalue=6.72e-74; confidence=weak
Rice	`Os08g0430500` (GF14C) - identity=69.9; qcov=0.29; evalue=3.88e-66; confidence=weak
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	smil04519 (Cadherin signaling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00244 (14-3-3); PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999616

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057781185.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057781185.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057781185.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781185.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:55442438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B85,C37,C62,C84
`Chr8:55442461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C4
`Chr8:55442662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D3
`Chr8:55442680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr8:55442703`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C80
`Chr8:55442756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B73
`Chr8:55442769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B89,C68
`Chr8:55442803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,C34,C81,C82
`Chr8:55442841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C43,C54
`Chr8:55442841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C43,C54
`Chr8:55442873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B43,B81,C11,C21,C35
`Chr8:55442930`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,C48,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781185.1

503 aa

252

503

14-3-3

RVT_2

PF00244 14-3-3 11-151 aa PF07727 RVT_2 411-492 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781185.1`	Pfam	`PF00244`	14-3-3	Repeat	11	151	3.8e-53	181.0	14-3-3 protein
`XP_057781185.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	411	492	1.4e-23	84.5	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925202.1
TACAAAGTCATAGAAAGCATGCATTCAAAGTCAGAAACATACAAAGTAATAAGTGTACAAAGTCAGGAATGAACAAAAATCCCTTAATCATAGGGATTTTTGTTTGACTATCATCTCACCCTTTGTAGTATAAAATGAATGATTGTAAATCAAACAATATCAAGAAATACAATTACAATCTTTAGCTTCTCTTTCTCTATGCATTATGATAATACAATGTTTCAACATGGTATCAGAGCAGGTTTAACCATAGGAACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130999616
ATGCCTCTGACAAGGGAGCAGTACCTCTACATGGCGAAGCTGGCGGAGCAAGCCGAGCGCTACGAGGAGATGGTCCTGTACATGGATAGCCTCGTGGCCTGCGCCGCCGGCTCCGAGCTCAACGTGGAGGAGCGCAACCTCCTCTCCGTCGCCTACAAGAACGTCATCGGCTCTCTGCGAGCGGCGTGGCGCATCGTCTCCTCCATCGAGCAGAAGGAGGAGGGCCGCAAGAACGACGACCACGTCCCGCTCGTCAAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057781185.1
MPLTREQYLYMAKLAEQAERYEEMVLYMDSLVACAAGSELNVEERNLLSVAYKNVIGSLRAAWRIVSSIEQKEEGRKNDDHVPLVKDYRSKVEAELSQVCAGILKLLADYLIPSAASSESKVFYLKMKGDYYRYLAEFKAGNDRKDAAAGASAGINGRTTEKNHEGGTKGEKEACGIGQKEKEAHDLGIGFDDYSSNPPTFPLSHFQSPIFRKLQKKPHFFESSPSSLWKSQNEPHVIKNSHTVIPNSIFDPKLCQNSKI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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