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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G000007`

染色体: Chr08 坐标: 93019-95292 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G000007`
名称	SmilChr08G000007
描述	probable receptor-like protein kinase At1g80640
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	93019 - 95292 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130999631`
GeneID	`130999631`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130999631`
原始查询	`LOC130999631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable receptor-like protein kinase At1g80640
产物	probable receptor-like protein kinase At1g80640
Arabidopsis	`AT4G32000` (AT4G32000) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829331] identity=61.1; qcov=0.984; evalue=1.71e-150; confidence=high
Rice	`Os05g0319700` - identity=58.7; qcov=1; evalue=4.08e-150; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130999631

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057781207.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057781207.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057781207.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057781207.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057781207.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:93631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:93635`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B137
`Chr8:93635`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B137
`Chr8:94397`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr8:94587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C24
`Chr8:94951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B121,B48,B94,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057781207.1

366 aa

183

366

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 73-282 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 75-336 aa

XP_057781208.1

366 aa

183

366

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 73-282 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 75-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057781207.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	73	282	2.4e-44	152.4	Protein kinase domain
`XP_057781207.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	75	336	3.5e-46	158.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057781208.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	73	282	2.4e-44	152.4	Protein kinase domain
`XP_057781208.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	75	336	3.5e-46	158.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057925225.1
AATATAGTCAAACTGGTCATTATTTTTGCTGAGGCGTTGCGATTTCATTTTCAACATAGGCGAGGCATGGATCAACTACTCTCAACTCAAACATGGCCGTGCATTAGTATTATAAGCTCTACCGCTTAACCGACTCACTCTCTCATTCCAATTTCATCTTTCAACTTTGATTTATCCATCCAAGCCGACGCTCTCACCCTCCATCTCCAGTGGCGAAGGAGGCATGAATTCGAATCACAAGCTGCTGACAGCAGTTATTT...

XM_057925224.1
CTCTCCCTCCTTCAACCGATTTGAAGATGAATTGCTCTAATTTGATTATACACCACGAATGCAAGTGGCGAAGGAGGCATGAATTCGAATCACAAGCTGCTGACAGCAGTTATTTCTGCTTCCACTGCGCTTCTTCTAGCTGGAGCAATCGTTTTGTTTGTTTTCTATGTCTACTACTACCGGAAGAAATCGCAGCGCCAAAATGTGTATAGTTGTTGTTCGGATAAGATGAGTGGTGGTCGCAGAAATATGATGATGGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130999631
ATGAATTCGAATCACAAGCTGCTGACAGCAGTTATTTCTGCTTCCACTGCGCTTCTTCTAGCTGGAGCAATCGTTTTGTTTGTTTTCTATGTCTACTACTACCGGAAGAAATCGCAGCGCCAAAATGTGTATAGTTGTTGTTCGGATAAGATGAGTGGTGGTCGCAGAAATATGATGATGGATTATAAGAGCATAGAATCAGCCACAGATAATTTTAGAGAGACTAACATGTTGGGTGCTGGTGGATTCGGATGCGTCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057781207.1
MNSNHKLLTAVISASTALLLAGAIVLFVFYVYYYRKKSQRQNVYSCCSDKMSGGRRNMMMDYKSIESATDNFRETNMLGAGGFGCVYQGNLQPGNISVAVKRLSNADAITEFQTEVELLSKIEHPNIITLLGYSIHAETRLLVYQLMHNGSLETQLHGPSRGSVLTWHLRLKIALDVARGLEYLHKRCHPPIIHRDLKSSNILLDSNFNAKLADFGLAILDGTQKKSQIKLSGTLGYVAPEYLLDGKLTDKSDVYAFGVV...

XP_057781208.1
MNSNHKLLTAVISASTALLLAGAIVLFVFYVYYYRKKSQRQNVYSCCSDKMSGGRRNMMMDYKSIESATDNFRETNMLGAGGFGCVYQGNLQPGNISVAVKRLSNADAITEFQTEVELLSKIEHPNIITLLGYSIHAETRLLVYQLMHNGSLETQLHGPSRGSVLTWHLRLKIALDVARGLEYLHKRCHPPIIHRDLKSSNILLDSNFNAKLADFGLAILDGTQKKSQIKLSGTLGYVAPEYLLDGKLTDKSDVYAFGVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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